Dan Gibson: How to build synthetic DNA and send it across the internet
דן גיבסון: איך לייצר דנ"א מלאכותי ולשגר אותו באינטרנט
Dan Gibson leads a new breed of bioengineers, called genome writers, who use DNA to design and build new products powering the next industrial revolution. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
על בניית תאים מלאכותיים
about building synthetic cells
מארגון בריאות בינלאומי,
from an international health organization,
בשפעת העופות אייץ'-7-אן-9.
the H7N9 bird flu.
moving across China.
חיסון שפעת שימנע מהמחלה להתפשט,
to produce a flu vaccine
לפני שהחיסון יהיה זמין,
for at least six months.
של חיסון השפעת
flu vaccine manufacturing process
והוא הברירה היחידה.
was the only option.
מפני מטופלים שנדבקו,
from infected patients,
לביצי תרנגולות,
the virus into chicken eggs,
במשך שבועות אחדים
for several weeks
לתהליך הרב-שלבי
for the start of a multistep,
של ייצור חיסון השפעת.
manufacturing process.
קיבלנו את הדוא"ל הזה
מדפסת ביולוגית
a biological printer,
את ההוראות להכנת חיסון השפעת
for the flu vaccine instructions
from the internet and printed.
את הכנת חיסוני השפעת
in which flu vaccines are made,
את יכולתנו לקרוא ולכתוב דנ"א
our ability to read and write DNA
"טלפורטציה ביולוגית".
biological teleportation.
שבונה דברים מדנ"א.
who builds stuff out of DNA.
אחד הדברים האהובים עלי
one of my favorite things to do
and put it back together
איך הוא עובד.
better how it works.
כמו תכנות מחשבים.
just like coders programing a computer.
ודברים כמו חיסונים ותרופות
and things like vaccines and therapeutics
that were previously impossible.
קרייג ונטר
recipient Craig Venter
שמכיוון שכל התפקודים והמאפיינים
of the functions and characteristics
כולל נגיפים ותאים חיים,
including viruses and living cells,
את קוד הדנ"א הזה,
that code of DNA,
במקום מרוחק.
in a distant location.
by biological teleportation.
ליצור, בפעם הראשונה,
of creating, for the first time,
מתוך קוד הדנ"א שבמחשב.
from DNA code in the computer.
as a scientist looking for a job,
אין יותר טוב מזה.
it doesn't get any better than this.
שנמצא בתוך האורגניזם.
of DNA within an organism.
מיפוי הגנום האנושי של 2003,
Genome Project in 2003,
effort to identify
של יצור אנושי,
of a human being,
בטכניקות של קריאת דנ"א
the techniques for reading DNA.
of the As, Cs, Ts and Gs
של כתיבת דנ"א,
the techniques for writing DNA.
או רצפים קצרים של קוד דנ"א,
as writing short sentences,
לכתיבת פסקאות
writing paragraphs
ליצירת חלבונים ותאים חיים.
for proteins and living cells.
הכי יעילות של הטבע ביצירת מוצרים חדשים,
machines at making new products,
מכלל שוק התרופות,
pharmaceutical market,
תיתן דחיפה נוספת לכלכלת הביולוגיה,
would drive this bioeconomy even more,
כמו מחשבים.
just like computers.
תאפשר טלפורטציה ביולוגית:
would enable biological teleportation ...
על פי קוד דנ"א.
biological material,
these promises to fruition,
בפעם הראשונה,
for the first time,
מקוד הד"נא הממוחשב.
של דנ"א ממספר חברות,
from a number of companies,
הכימיקלים האלה שמהם מורכב דנ"א,
bottles of chemicals that make up DNA,
מקטעי דנ"א קצרים מאד.
those very short pieces of DNA for you.
developing the technology
וחיבורם לגנומים חיידקיים שלמים.
those short pieces of DNA
מכיל מעל מיליון אותיות,
contained over one million letters.
of your average novel,
בסדר הנכון,
of those letters in the correct order,
בכך שפיתחנו נוהל שרציתי לכנות,
by developing a procedure
isothermal in vitro recombination method."
לא אהבה את השם הטכני המדויק הזה,
didn't like this technically accurate name
תקן הזהב
is now the gold standard tool,
גנום חיידקי מלא,
the complete bacterial genome,
למצוא דרך
בעל כושר שכפול עצמאי.
self-replicating cell.
כאל מערכת ההפעלה של התא,
as the operating system of the cell,
הנחוצה לאיתחול הגנום.
necessary to boot up the genome.
יכולנו לתכנת תאים מחדש
where we could reprogram cells
bacterial species into another,
בזה של תא אחר.
with that of another.
סללה את הדרך
technology then paved the way
written by scientists
לקריאה וכתיבה של דנ"א
for reading and writing DNA
התא הסינטטי הראשון,
when we announced the creation
was sequenced, back in 1995,
אלפי גנומים חיידקיים נוספים מלאים.
have been sequenced and stored
הוכיחה את התפישה האומרת
was the proof of concept
של גנום חיידקי שלם
sequence out of the computer
לתא חי, עצמאי ומשתכפל,
into a free-living, self-replicating cell,
מהמין שבנינו.
of the species that we constructed.
why there may be concerns
תפעול גנים ברמה כזאת.
of genetic manipulation.
של תועלת חברתית רבה,
for great societal benefit,
שבוצע הניסוי הראשון,
carrying out the very first experiment,
עם הציבור והממשלה
with the public and the government
ולפקח עליה באופן אחראי.
and regulate this new technology.
היתה לבדוק כל לקוח
was to screen every customer
בידי אנשים רעים,
are not being made by bad guys,
מדווחות לבולשת הפדרלית
are reported to the FBI
law-enforcement agencies.
יעניקו דחיפה למהפכה התעשייתית הבאה
will power the next industrial revolution
global sustainability challenges.
biobased sources,
מחיידקים מהונדסים,
from engineered microbes,
שיודפסו ליד מיטת החולה.
printed at a patient's bedside.
to create synthetic cells
בכתיבת דנ"א.
we found ways to write DNA faster,
מדויקת יותר ואמינה יותר של דנ"א,
of these technologies,
להפוך את התהליכים לאוטומטיים,
readily automate the processes
מידי המדענים
out of the scientist's hands
במספר יישומים
essential in writing DNA
יחד עם חוקרים בעולם.
around the world are working on.
לבהלה של שפעת העופות בסין.
about the H7N9 bird flu scare in China.
כבר בודד את הנגיף,
had already isolated the virus,
והעלה את הרצף הזה לאינטרנט.
the DNA sequence to the internet.
הורדנו את רצף הדנ"א,
we downloaded the DNA sequence
הדפסנו אותו ב"ביו אקס פי".
we printed it on the BioXp.
את הדנ"א המלאכותי הזה לחיסון שפעת.
that synthetic DNA into a flu vaccine.
בטכנולוגיה של שנות ה-40,
dating back to the 1940s,
to arrive from China
מבוסס הביצים.
their egg-based approach.
שפותח מבעוד מועד
developed ahead of time
dangerous strain,
יותר מאי-פעם בעבר
to appreciate, more than ever,
התחלנו לבנות טלפורטר ביולוגי.
a biological teleporter.
"ממיר מדיגיטלי לביולוגי".
digital-to-biological converter.
short pieces of DNA,
עם קוד דנ"א שעבר דיגיטציה
ליישויות ביולוגיות,
into biological entities,
ואף נגיפים.
proteins or even viruses.
כעל נגן תקליטורים
as a DVD player,
"נטפליקס".
עבד עם מהנדסי תוכנה ומיכשור
software and instrumentation engineers
שצופים איזה דנ"א יש לבנות,
to predict what DNA to build,
לכלל פיסות קצרות,
building blocks of DNA into short pieces,
לפיסות ארוכות יותר,
those short pieces into much longer ones,
ליישויות ביולוגיות אחרות,
into other biological entities,
הוא הוכיח את יעילותו.
it was effective.
שבועות או חודשים,
that once took weeks or months
ביום או יומיים בלבד.
in just one to two days.
any human intervention
מכל מקום בעולם.
by the receipt of an email
from anywhere in the world.
למכשירי הפקס.
the DBC to fax machines.
מקבלים תמונות ומסמכים,
received images and documents,
fax machines have evolved.
של המאה ה-19
is unrecognizable,
לא ידעו מהו מכשיר פקס,
still didn't know what a fax machine was,
התקשה לתפוש את הרעיון
to grasp the concept
בקצה השני של העולם.
on the other side of the world.
כל מה שמכשיר פקס עושה,
that a fax machine does
המהירים האלה מובנים מאליהם.
of digital information for granted.
כפי שהתפתחו מכשירי הפקס.
in similar ways as fax machines have.
the size of the instrument,
המהירות והדיוק של הטכנולוגיה שביסודו.
the underlying technology
faster and more accurate.
בסינתוז דנ"א,
when synthesizing DNA,
תעבוד או לא
between a medicine working or not
יהיה חי או מת.
של תרופות מבוססות דנ"א.
for the distributed manufacturing
יוכל להשתמש בדי-בי-סי
could use a DBC
ליד מיטתם.
for a patient at their bedside.
שיום אחד ישתמשו בדי-בי-סי
when it's routine for people to have a DBC
למחשב בבית או לטלפון החכם
home computer or smart phone
כמו אינסולין או טיפול בנוגדנים.
their prescriptions,
כשיוצב במקומות אסטרטגיים בעולם
in strategic areas around the world,
באטלנטה שבג'ורג'יה
לדי-בי-סי בעברו השני של העולם,
to a DBC on the other side of the world,
בחזית הלחימה במחלה.
right on the front lines.
specifically tailored to the flu strain
שפועל באותו אזור.
ולשלוח אותם,
vaccines and shipping them out,
go as far as the imagination goes.
שמוצב בכוכב-לכת אחר.
placing a DBC on another planet.
לאותו די-בי-סי הוראות דיגיטליות
the digital instructions to that DBC
או אורגניזמים מלאכותיים
or to make synthetic organisms
fuel or building materials,
מתאים יותר לחיי אדם.
more habitable for humans.
traveling at the speed of light,
למשלוח הוראות דיגיטליות
to send those digital instructions
למשלוח הדגימות עצמן בחללית.
to physically deliver those same samples
בשיגור תרופות חדשות לקצה העולם,
beaming new medicines across the globe,
infectious diseases
לסרטן למי שאינם יכולים לחכות להן.
for those who don't have time to wait.
ABOUT THE SPEAKER
Dan Gibson - Genome writerDan Gibson leads a new breed of bioengineers, called genome writers, who use DNA to design and build new products powering the next industrial revolution.
Why you should listen
In 2004, Dan Gibson was drawn to a project at the J. Craig Venter Institute: to build a synthetic cell from scratch. Within days, he was on a path to creating synthetic life alongside genomics pioneers. But to build a whole genome from scratch, Gibson had to first invent new methods to assemble DNA. One method, dubbed the "Gibson Assembly," became a game changer, and a series of firsts followed: first synthetic bacterial genome, first synthetic cell, first minimal cell. Today, these discoveries inform the design of synthetic DNA used for new medicines.
Gibson's teams at SGI and SGI-DNA recently introduced the world's first biologic teleporter, called the Digital-to-Biological Converter (DBC), which turns digital code into functional biologics in the form of DNA, RNA and proteins without human intervention. Imagine a future where digital code is emailed to DBCs at hospitals around the world to deliver personalized medicine at a patient's bedside.
Dan Gibson | Speaker | TED.com