David Baker: 5 challenges we could solve by designing new proteins
دیوید بِیکر: ۵ چالشی که میتوانیم با طراحی پروتئینهای جدید حل کنیم
David Baker designs new biomolecules (proteins) from first principles to address 21st-century challenges in health and technology. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
amazing machines in the world
ماشین دنیا به شما بگویم
با آنها انجام دهیم.
در داخل یک سلول اینجا میبینید،
functions in our bodies.
در بدن ما را انجام میدهند.
of building blocks called amino acids.
اجزای سازندهای به نام آمینو اسیدها هستند.
۲۰ آمینو اسید استفاده میکند،
you may have heard of.
که ممکن است شنیده باشند.
each bump is an atom.
هر برآمدگی، یک اتم است.
cause these long stringy molecules
باعث میشود این مولکولهای رشتهای بلند
three-dimensional structures.
و سهبعدی تبدیل شوند.
در هر زمان تا میشود،
to its characteristic shape each time,
ثانیه طول میکشد.
takes just a fraction of a second.
their remarkable biological functions.
بیولوژیکی قابلتوجه خود را انجام دهند.
in the lungs perfectly suited
ماهیچه شما حرکت میکند،
در زنجیره پروتئین مشخص میشوند.
of amino acids in the protein chain.
on top is an amino acid.
یک آمینو اسید است.
specify the amino acid sequences
sequence of a single protein.
منحصربهفرد را رمزگذاری میکند.
these amino acid sequences
and functions of proteins
shapes a protein can adopt.
یک پروتئین میتواند به خود بگیرد.
to harness the power of proteins
در توالی مولکولهای آمینو اسیدها
to the amino acid sequences
that our Stone Age ancestors used
from the sticks and stones
اسباب دیگر از چوب و سنگهایی
به کار میگرفتند.
by modifying birds.
با تغییر دادن پرندهها پرواز کنند.
uncovered the principles of aerodynamics.
اصول آیرودینامیک را کشف کردند.
to design custom flying machines.
هواپیما استفاده کردند.
principles of protein folding
in the computer program called Rosetta.
به نام «رُزِتا» کار کردهایم.
from scratch on the computer.
-های جدید را از روی کامپیوتر طراحی کنیم.
in a synthetic gene.
در ژن ترکیبی کدگذاری کردیم.
is completely new,
which currently exists that encodes it.
زمین وجود دارد نیست که آن را رمزگذاری کند.
protein folding
of gene synthesis
in computing power,
tens of thousands of new proteins,
تا دهها هزار پروتئین جدید،
با ژن مصنوعی کدگذاری کنیم.
in a synthetic gene.
these brand-new proteins.
این پروتئینهای جدید را بسازند.
را طراحی کردهایم، عملکرد دارند یا خیر
as we designed them to
ساخت پروتئینهای جدید باشیم،
to make new proteins,
of the total number of proteins possible.
پروتئینها را نمونهبرداری کردهاست.
an alphabet of 20 amino acids,
۲۰ آمینو اسید استفاده میکند،
of about 100 amino acids,
زنجیرهای از حدود ۱۰۰ آمینو اسید است،
is 20 times 20 times 20, 100 times,
۲۰ برابرِ ۲۰، ۱۰۰ بار است،
of 10 to the 130th power,
than the total number of proteins
کل تعداد پروتئینهایی است
since life on earth began.
using computational protein design.
پروتئین محاسباتی، بررسی کنیم.
faced by natural evolution.
فرگشتِ طبیعی تکاملیافته اند.
جدیدی رو به رو هستیم
پس بیماریهای جدید مهم هستند.
diseases are important.
و آلودگی این سیاره هستیم،
of ecological challenges.
چالشهای زیستمحیطی رو به رو هستیم.
برای صبر کردن داشتیم،
to solve those challenges.
برای حل این چالشها تکامل یابند.
millions of years to wait.
protein design,
to address these challenges today.
برای پرداختن به این چالشها استفاده کنیم.
biology out of the Stone Age
خارج کردن بیولوژی از عصر حجر
in protein design.
در طراحی پروتئین است.
that we can design new proteins
میتوانیم پروتئینهای جدید را
با تحریک سیستم ایمنی شما
by stimulating your immune system
against a pathogen.
به بیماریزاها کار میکنند.
proteins from pathogens,
از پروتئینهای بیماریزا،
from the respiratory virus RSV.
تنفسی (ویروس سینسیشیال) در هم بیامیزیم.
with the viral protein,
immune response to the virus
نسبت به ویروس دارند
that have been tested.
is currently one of the leading causes
زیرا ویروس سینسیشیال تنفسی (RSV)
نوزادان در سراسر جهان است.
to break down gluten in your stomach
برای بیاثرکردن گلوتن در معده
your immune system to fight cancer.
شما جهت مبارزه با سرطان طراحی کردهایم.
of the protein design revolution.
انقلابِ طراحی پروتیین هستند.
technological revolution:
تکنولوژیک پیشین الهامگرفته ایم:
due to advances in one place,
در یک مکان، در بخش بزرگی نیز رخ داد
collaborative environment,
محلی با محیط باز و مشارکتی بود،
from around the world.
را از سراسر جهان جذب کند.
string of innovations --
نوآوریهای قابل ملاحظه شد --
satellite communication
the Bell Laboratories of protein design.
طراحی پروتئین است.
talented scientists from around the world
از سراسر جهان هستیم
design revolution,
on five grand challenges.
from around the world
انواع آنفلوانزا از سراسر دنیا
of the designed protein particles
ذرات پروتیینی طراحیشده
of protection against the flu.
آنفلوآنزا را میدهد.
new vaccines on the computer
against natural flu epidemics
همهگیرشدن آنفلوآنزای طبیعی
acts of bioterrorism.
nature's limited alphabet
for conditions such as chronic pain,
برای شرایطی مانند دردهای مزمن
of thousands of amino acids.
از هزاران آمینو اسید استفاده میکنیم.
advanced delivery vehicles
تجهیزات پیشرفتهای
exactly where they need to go in the body.
جایی که باید، به بدن وارد کنند، هستیم.
where gene repair needs to take place.
در آنجا ترمیم ژنی باید صورت گیرد.
that can do calculations within the body
که قادر است محاسباتی در بدن انجام دهند،
subset of immune cells
یک زیرمجموعه کوچک از سلولهای ایمنی
majority of healthy immune cells.
ایمنی سالم تشخیص میدهد.
biological materials
tooth and others,
دندان و چیزهای دیگر،
protein-based materials
مبتنی بر پروتئین هستیم تا
and ecological issues.
زیست محیطی بپردازیم.
we're growing our institute.
در حال گسترش موسسهمان هستیم.
talented and diverse scientists
بااستعداد و متنوع
at all career stages,
in the protein design revolution
folding and design game, "Foldit."
ما «Foldit» شرکت کنید.
computing project, Rosetta@home,
Rosetta@home
or your Android smartphone.
به ما بپیوندید.
through protein design is my life's work.
با طراحی پروتئین، کار من است.
what we can do together.
با یاری هم بکنیم هیجانزدهام.
ABOUT THE SPEAKER
David Baker - Computational biologistDavid Baker designs new biomolecules (proteins) from first principles to address 21st-century challenges in health and technology.
Why you should listen
David Baker is fascinated by biological self-organization. For example: How does the information stored in DNA translate into the intricate world of proteins and cells? The DNA code was solved more than 50 years ago, but the protein folding code has remained one of biology's greatest challenges. Starting 20 years ago, Baker's research team began using computers to model the structures of proteins. His work has advanced to the point where he can now not only predict the shape of natural proteins but also design completely new ones. In recent years, he's designed new experimental cancer therapies, vaccines, nanomaterials and more. He believes that the emerging field of protein design will fundamentally change how people make medicines, materials and more around the world. Now that the protein folding code is solved, the sky's the limit.
Baker is a Professor of Biochemistry and the Director of the Institute for Protein Design at the University of Washington in Seattle. He's also an Investigator at the Howard Hughes Medical Institute and Adjunct Professor of Genome Sciences, Bioengineering, Chemical Engineering, Computer Science, and Physics at the UW. With his colleagues, he developed the Rosetta Commons, the Rosetta@Home project and Foldit, a science video game. He has also launched more than ten companies that are seeking to bring designed proteins into the real world.
David Baker | Speaker | TED.com