Riccardo Sabatini: How to read the genome and build a human being
Riccardo Sabatini: Wie man das Genom liest und einen Menschen erschafft
Riccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions. Full bio
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I'm going to take you on a journey
nehme ich Sie mit auf eine Reise,
the biggest dream of humanity:
many, many years ago
mit dem ersten 3D-Drucker machte.
raw material, some energy,
that was not there before.
das vorher nicht da war.
I was coming back home
kam nach Hause zurück
always knew a 3D printer.
einen 3D-Drucker kannte.
my father and my mom in this case,
von meinem Vater und meiner Mutter --,
in the same media, that is food,
-- beides als Lebensmittel --
brachte sie mich zu Stande.
discovering that she was a 3D printer,
dass meine Mutter ein 3D-Drucker war,
by that piece,
lassen sich damit füllen?
at the beginning
as a gigantic Lego piece.
als Analogie für einen Menschen.
blocks are little atoms
die Bausteine seien kleine Atome
a carbon here, a nitrogen here.
da ein Kohlenstoff
that compose a human being,
die einen Menschen ausmachen.
quite an astonishing number.
erstaunliche Anzahl zu sein.
die man für ein Baby benötigt
drive to assemble a little baby,
of thumb drives --
a pregnant lady,
mit einer Schwangeren
amount of information
anything you heard of.
vergessen Sie, wovon sie gehört haben.
of information that exists.
existierende Datenmenge.
than a young physicist,
viel schlauer als ein junger Physiker
to pack this information
namens DNA, zu packen.
when Rosalind Franklin,
eine erstaunliche Wissenschaftlerin,
to finally poke inside a human cell,
bis man in eine menschliche Zelle blickte,
a fairly simple alphabet,
ziemlich einfaches Alphabet heraus.
you need three billion of them.
benötigt man davon drei Milliarden.
any sense as a number, right?
I could explain myself better
wie ich mir besser verdeutlichen könnte,
I'm going to have some help,
dabei helfen kann, den Code vorzustellen,
introduce the code
in eine Reihenfolge brachte:
to sequence it, Dr. Craig Venter.
Dr. Craig Venter.
eines bestimmten Menschen aus,
450 Kilogramm schwer,
from the United States to Canada
Lulu.com, a start-up, did everything.
der alles Erforderliche unternahm.
of what is the code of life.
wahrnehmbare Code des Lebens.
I can do something fun.
book ... like this one.
it's a fairly big book.
es ist ein ziemlich dickes Buch.
what is the code of life.
was der Code des Lebens ist.
the color of the eyes to Craig.
erhält Craig seine Augenfarbe.
more complicated.
two letters in this position --
an dieser Stelle fehlen --
zu einer schrecklichen Krankheit:
to a terrible disease:
we don't know how to solve it,
und man kennt keine Lösung.
of difference from what we are.
die uns unterscheiden.
etwas Bemerkenswertes zeigen ließ.
me, me and you, you --
sind ungefähr 5 Millionen nötig,
das Wunder ihres Lebens.
is the miracle of life that you are.
wir seien unterschiedlich.
when we think that we are different.
at assembling Swedish furniture,
schwedischer Möbel sein mögen,
is nothing you can crack in your life.
in Ihrem ganzen Leben nicht knacken.
zwei berühmte TEDster,
und alles aus diesen Büchern zu erfahren,
we can learn from these books,
zu verwirklichen,
of personalized medicine,
should be done to have better health
um die Gesundheit zu verbessern
in diesen Büchern sind.
und viele weitere Leute,
and many, many more people,
called machine learning.
die man Maschinelles Lernen nennt.
thousands of them.
the biggest database of human beings:
den größten Datenbestand zum Menschen:
everything you can think of.
Nuklearmagnetresonanz --
and we train a machine --
many, many machines --
sondern viele Maschinen --,
the genome in a phenotype.
in Erscheinungsformen zu übertragen.
and what do they do?
und wozu führen sie?
be used for everything,
der für alles genutzt werden kann,
ist teilweise kompliziert.
is particularly complicated.
to build different challenges.
unterschiedlichen Aufgaben.
from common traits.
mit gemeinsamen Merkmalen.
because they are common,
weil wir sie gemeinsam haben.
unsere Fragen zu stellen:
and predict your height?
und ihre Größe vorhersagen?
bis auf 5 Zentimeter.
an unserem Lebensstil,
eight kilograms of precision.
von 8 Kilogramm nahe dran.
80-prozentige Treffsicherheit.
the code changes during your life.
anscheinend während des Lebens.
it gets insertions.
bekommt Einschübe.
und erstellen ein Modell.
among millions of these letters.
ist auf Millionen Buchstaben verstreut.
a very well-defined object.
sehr genau abgegrenztes Objekt.
eine ganze Maske erstellen,
a machine what a face is,
auf das Wesentliche reduzieren,
was ein Gesicht ist.
with machine learning,
Lernen vertraut sind,
die Herausforderung liegt.
we read the first sequence --
die erste Sequenz gelesen hat --
to see some signals.
einige Signale zu verstehen.
coming in our lab.
die in unser Labor kam.
we reduce the complexity,
des Gesichts einer echten Person,
ist ursprünglich vorhanden --
and asymmetries come from your life.
ergeben sich im Verlauf des Lebens.
and we run our algorithm.
und ließen unseren Algorithmus laufen.
from the blood.
left and right, left and right,
in denen Sie hin und her blicken,
those pictures to be identical.
dass die Bilder identisch sind.
der Ehrlichkeit halber,
another exercise, to be honest.
comes from gender,
ergibt sich aus dem Geschlecht,
the ethnicity component of a human.
und der ethnischen Zugehörigkeit.
is much more complicated.
ist viel komplizierter.
even in the differences,
sogar trotz der Unterschiede,
that we are in the right ballpark,
bei der richtigen Hausnummer sind
einige Gefühle hervor.
that comes in place,
the complete cranial structure,
die Schädelstruktur stimmt nicht ganz,
die richtige Größenordnung.
die in unser Labor kam,
in the training of the machine.
der Maschinen eingebunden.
sogenannten "Bereitschaftsgruppe".
probably never believe.
aber das sind echte Menschen.
in a scientific publication,
wissenschaftlichen Veröffentlichung ab,
Chris challenged me.
fordert Chris mich heraus.
and tried to predict
und versuchte eine Vorhersage zu jemandem,
and believe me, you have no idea
was wir anstellen mussten,
this blood now, here --
of biological information
Genom-Sequenz benötigen.
und ich werde es mit Ihnen machen.
and I'm going to do it with you.
all the understanding we have.
vorhandenen Erkenntnisse an.
we predicted he's a male.
das männliche Geschlecht vorher.
dass er 1 Meter und 76 cm groß ist.
the subject is 82.
dass er 76 Kilo schwer ist,
and peculiar ethnicity.
und eigentümlichen Ethnie an.
they never fit in models.
sie passen zu keinem Modell.
is a complex corner case for our model.
für unser Modell ist.
a lot to recognize people
zur Personenerkennung nutzen,
es ist wie ich aussehe.
but my beard cut.
aber wie mein Bart gestutzt ist.
in this case, transfer it --
than Photoshop, no modeling --
kein Modellieren --
much, much better in the feeling.
einen besseren Eindruck davon.
for predicting height
um die Größe vorherzusagen
out of your blood.
ein schönes Bild zu erstellen.
and the same approach,
und dieselbe Herangehensweise,
wie wir funktionieren,
in unserem Körper entwickeln,
researchers around the world.
anderer Forscher weltweit teilen.
from a statistical approach
sich von einen statistischen Ansatz,
personalisierten Ansatz,
of exactly how you are.
wie es einem genau geht.
complicated challenge,
komplizierte Aufgabe,
nach heutigem Stand
in the world on this topic.
sind an diesem Thema dran.
be confronted with decisions
mit Entscheidungen konfrontiert,
der Funktionsweise des Lebens.
inner detail on how life works.
that cannot be confined
oder der Technologie begrenzt werden kann.
we're building as a humanity.
unserer Menschheit nachdenken.
with artists, with philosophers,
Künstlern, Philosophen,
that we make in the next year
die wir in den nächsten Jahren treffen,
für immer verändern.
ABOUT THE SPEAKER
Riccardo Sabatini - Scientist, entrepreneurRiccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions.
Why you should listen
Data scientist Riccardo Sabatini harnesses numerical methods for a surprising variety of fields, from material science research to the study of food commodities (as a past director of the EU research project FoodCAST). His most recent research centers on computational genomics and how to crack the code of life.
In addition to his data research, Sabatini is deeply involved in education for entrepreneurs. He is the founder and co-director of the Quantum ESPRESSO Foundation, an advisor in several data-driven startups, and funder of The HUB Trieste, a social impact accelerator.
Riccardo Sabatini | Speaker | TED.com