Riccardo Sabatini: How to read the genome and build a human being
ریکاردو ساباتینی: چگونگی خواندن نقشه ژنتیکی و تولید انسان
Riccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
I'm going to take you on a journey
شما را به سفری می برم
the biggest dream of humanity:
ازسالها پیش آغاز شد
many, many years ago
raw material, some energy,
مقداری انرژی ،
that was not there before.
وجود نداشته را تولید کند.
I was coming back home
در حال برگشت به خانه بودم
always knew a 3D printer.
یک چاپگر سه بعدی را می شناختم.
my father and my mom in this case,
بین پدرم و مادرم است
in the same media, that is food,
که مواد خواراکی است ،
discovering that she was a 3D printer,
که یک چاپگر سه بُعدی است به کنار ،
by that piece,
مقدار اطلاعات نیاز است ؟
می توانید پُر کنید ؟
at the beginning
as a gigantic Lego piece.
بصورت یک لِگوی بزرگ فرض کردم
blocks are little atoms
هر قطعه ، یک اتم است .
a carbon here, a nitrogen here.
یک کربن اینجا ، یک نیتروژن اینجا .
that compose a human being,
یک انسان از آنها ساخته شده را لیست کنم
quite an astonishing number.
drive to assemble a little baby,
روی فلش مموری بریزم ،
of thumb drives --
از فلش مموری پر خواهد کرد
a pregnant lady,
amount of information
میزانِ اطلاعاتی است
anything you heard of.
را فراموش کنید
of information that exists.
than a young physicist,
بسیار با هوش تر است
to pack this information
این اطلاعات را بسته بندی کرده است
که ما آنرا دی اِن اِی مینامیم.
when Rosalind Franklin,
وقتی که روزالیند فرنکلین
to finally poke inside a human cell,
سلول انسان را بشکافیم
a fairly simple alphabet,
you need three billion of them.
شما به سه میلیارد از آنها نیاز دارید.
any sense as a number, right?
درست ؟
I could explain myself better
که چطور بهتر برای خودم تشریح کنم
I'm going to have some help,
الان به کمک احتیاج خواهم داشت.
introduce the code
به من کمک می کند
to sequence it, Dr. Craig Venter.
آنرا مرتب کرد ، دکتر کریگ ونتر
چاپ شده است
from the United States to Canada
با کشتی از آمریکا به کانادا حمل شده است
Lulu.com, a start-up, did everything.
lulu.com ، یک استارتاپ همه کار کرد.
of what is the code of life.
نمایان می شود.
I can do something fun.
می توانم کاری بامزه انجام دهم.
book ... like this one.
مثل این یکی.
it's a fairly big book.
what is the code of life.
کُد زندگی چگونه است
the color of the eyes to Craig.
برای کریگ مشخص می کنند
more complicated.
two letters in this position --
در این موقعیت کم داشته باشد
to a terrible disease:
we don't know how to solve it,
of difference from what we are.
me, me and you, you --
آنچه مرا من و شما را شما می کند
is the miracle of life that you are.
که شما هستید.
when we think that we are different.
ما فکر میکنیم با هم متفاوتیم
at assembling Swedish furniture,
اثاثه سوئدی را بپینید
is nothing you can crack in your life.
که بتوانید در عمر خود، راز آنرا بشکافید
دو نفر از سخنرانانِ مشهورِ TED
we can learn from these books,
از این کتابها بیاموزیم
of personalized medicine,
طب شخصی
should be done to have better health
باعث سلامتی و بهبود می شود.
and many, many more people,
متخصص پردازش داده ها و خیلی افراد دیگر
called machine learning.
استفاده خواهیم کرد.
thousands of them.
در دست داریم.
the biggest database of human beings:
مربوط به انسان را جمع آوری می کنیم
everything you can think of.
هرچه که فکرش را بکنید.
and we train a machine --
و به آن آموختیم
many, many machines --
دستگاههای زیادی ساختیم
the genome in a phenotype.
به رُخ نمود ترجمه کند.
and what do they do?
و چه کاری انجام می دهند؟
be used for everything,
موارد استفاده ی بیشماری دارد.
is particularly complicated.
پیچیده است
to build different challenges.
تا چالش های مختلف بیافرینیم
from common traits.
از شاخصه های مشترک
because they are common,
چون مشترک هستند
قدتان را حدس زد ؟
and predict your height?
eight kilograms of precision.
آنرا حدس بزنیم
رنگ پوست را حدس زد.
the code changes during your life.
کد در طول زندگی تغییر می کنند
it gets insertions.
تکه های جدید بوجود می آیند
نمونه را می سازیم
among millions of these letters.
مابین میلیونها حرف پخش شده است
a very well-defined object.
تعریف شده مشخصی نیست
که حلال این مشکل را بسازیم
a machine what a face is,
که یک چهره چیست
with machine learning,
آشنایی داشته باشید
we read the first sequence --
ما اولین توالیِ کدها را خواندیم
to see some signals.
coming in our lab.
که وارد آزمایشگاه ما شد
we reduce the complexity,
از پیچیدگیهای آن می کاهیم
and asymmetries come from your life.
و عدم تقارن در چهره از زندگیِ شما می آیند.
and we run our algorithm.
سپس الگوریتم مان را راه میاندازیم.
from the blood.
از روی نمونه خون انجام دادیم
left and right, left and right,
نگاه می کنند
those pictures to be identical.
شبیه به هم باشند
another exercise, to be honest.
که صادقانه طور دیگر عمل کنید.
comes from gender,
مربوط به جنسیت هستند ،
the ethnicity component of a human.
مولفه های نژادی یک فرد
is much more complicated.
کار را بسیار پیچیده تر می کند.
even in the differences,
آنچه که شما می بینید
that we are in the right ballpark,
که درست تخمین زده شده است،
that comes in place,
the complete cranial structure,
ما تمام ساختار جمجمه را درست حدس نزدیم
in the training of the machine.
هرگز حضور نداشتند.
probably never believe.
شما احتمالا باور نخواهید کرد.
in a scientific publication,
یک نشریه علمی منتشر می کنیم،
Chris challenged me.
کریس مرا به چالش کشید.
and tried to predict
و کسی را همینجا حدس بزنم
and believe me, you have no idea
باور کنید، فکرش را هم نمی کنید
this blood now, here --
مجبور به انجام چه کاری شدیم.
of biological information
بقدری اطلاعات بیولوژیکی داریم
رشته کامل ژنها نیاز است
and I'm going to do it with you.
و من الان با شما آنرا انجام خواهم داد.
all the understanding we have.
به درک خود اضافه می کنیم.
we predicted he's a male.
the subject is 82.
سوژه ۸۲ کیلوگرم وزن دارد.
and peculiar ethnicity.
they never fit in models.
هرگز نمونه ی خوبی نیستند.
is a complex corner case for our model.
گوشه ی پیچیده ی پرونده ی نمونه های ماست
a lot to recognize people
تشخیص افراد انجام می دهیم
که من این شکلی هستم.
but my beard cut.
بلکه مدل ریش من.
in this case, transfer it --
انرا جابجا خواهم کرد.
than Photoshop, no modeling --
نمونه برداری نشده است
much, much better in the feeling.
for predicting height
انجام نمی دهیم
out of your blood.
از خونِ شما استخراج کنیم
and the same approach,
و همین رویکرد
کمک می کند.
researchers around the world.
from a statistical approach
رویکرد آماری
of exactly how you are.
آگاه می شویم.
complicated challenge,
فقط حدود دو درصد از این کتابها را میفهمیم.
in the world on this topic.
مشغول مطالعه روی این موضوع هستند.
be confronted with decisions
با آنها روبرو شویم
جزئیات زندگی هستیم.
inner detail on how life works.
that cannot be confined
نمی تواند محدود شود
we're building as a humanity.
در حال ساخت آن هستیم بیاندیشیم.
with artists, with philosophers,
و با سیاستمدارن داد و ستد داشته باشیم.
that we make in the next year
ABOUT THE SPEAKER
Riccardo Sabatini - Scientist, entrepreneurRiccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions.
Why you should listen
Data scientist Riccardo Sabatini harnesses numerical methods for a surprising variety of fields, from material science research to the study of food commodities (as a past director of the EU research project FoodCAST). His most recent research centers on computational genomics and how to crack the code of life.
In addition to his data research, Sabatini is deeply involved in education for entrepreneurs. He is the founder and co-director of the Quantum ESPRESSO Foundation, an advisor in several data-driven startups, and funder of The HUB Trieste, a social impact accelerator.
Riccardo Sabatini | Speaker | TED.com