Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
Dan Knights: Cómo estudiamos los microbios que viven en su intestino
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
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that's living in your gut,
que vive en su intestino,
probablemente dirían E. coli.
It's the best-known of the gut microbes.
de los microbios intestinales.
is outnumbered in your gut
en su intestino la superan
you probably haven't heard of.
probablemente no han oído hablar.
Prevotella is another example.
la Prevotella es otro ejemplo.
the modern human gut.
el intestino humano moderno.
microbes living inside you.
microbios que viven en nuestro interior.
viviendo dentro de cada uno...
living inside you --
if you took a blade of grass
si se planta una brizna de hierba
living in your gut,
que vive en el intestino,
un millón de campos de fútbol.
to life in modern society,
a la vida en la sociedad moderna,
algunos de nuestros microbios normales,
related to the gut
relacionadas con el intestino
in developed nations all around the world.
desarrolladas de todo el mundo.
someone who suffers from obesity,
conocen a alguien que sufre de obesidad,
or ulcerative colitis,
o colitis ulcerosa,
and autoimmunity
con el metabolismo y la autoinmunidad
of healthy diversity in the gut.
de diversidad saludable en el intestino.
nuestra primera evidencia de ello
non-human primates.
estudiando primates no humanos.
to a monkey's microbiome
al microbioma de un mono
de la jungla a un zoológico.
Do they pick up new bugs?
¿Obtienen nuevos microbios?
Does it get better or worse?
species in the jungle,
en la jungla,
the DNA from their stool.
in my research lab.
en mi laboratorio de investigación.
is that in the wild,
es que en la naturaleza,
totally different sets of microbes.
de microbios totalmente diferentes.
para la especie.
most of that diversity
la mayor parte de esa diversidad
some other set of microbes.
algún otro conjunto de microbios.
tropical rainforest
una exuberante selva tropical
that we're talking about.
de la que estamos hablando.
han perdido diversidad.
that's been burned to the ground
que ha sido quemada en el suelo
por algunas especies invasoras.
in a captive primate.
al microbioma en un primate cautivo.
no les está yendo muy bien.
are not doing so well.
holding onto their lives.
apenas se aferraban a sus vidas.
very interested to find out
muy interesados en descubrir
that are taking over in the zoo.
que invaden el control en el zoológico.
and what the DNA told us
y lo que el ADN nos dijo
by Bacteroides and Prevotella,
por Bacteroides y Prevotella,
in our guts as modern humans.
nuestras entrañas como humanos modernos.
una manera de visualizar esto,
from multivariate ecology
de ecología multivariante
we were studying onto an axis.
que estábamos estudiando en un eje.
is a distance plot
es una trama de distancias
is a different animal's microbiome.
el microbioma de un animal diferente.
a whole zoo of microbes.
un zoológico completo de microbios.
that have a lot of microbes in common
muchos microbios en común
are farther apart.
están más separados.
están a la izquierda.
are over on the left.
highly endangered monkeys
estos monos altamente amenazados
de Vietnam.
are monkeys from Costa Rica.
hay monos de Costa Rica.
totalmente diferentes en la naturaleza.
totally different microbiomes in the wild.
of monkey in the zoo are converging,
de monos en el zoológico convergen,
much more similar to each other,
on different continents,
en diferentes continentes,
and they're eating different diets.
y están comiendo diferentes dietas.
some other species of primate.
otras especies de primates.
do you think is even more divergent
que son aún más divergentes
than the captive primates?
con respecto a los primates en cautiverio?
living in developing nations.
que viven en países en desarrollo.
from the wild primates
de los primates salvajes
all the way on the right,
todo el camino a la derecha,
on the back of my neck,
en la parte posterior del cuello,
"Oh, that's interesting,
"Oh, eso es interesante,
to becoming like Americans."
de convertirse en estadounidenses".
are like super-captive monkeys.
como monos supercautivos.
at this figure on my computer screen
en la pantalla de mi computadora
that four of the red-shanked doucs
cuatro de los monos pigatrix
relacionados con el intestino.
living inside them
viviendo dentro de ellos
to the human part of the story.
a la parte humana de la historia.
as frequently as in the zoo,
con tanta frecuencia como en el zoológico,
of obesity, diabetes,
un gran riesgo de obesidad, diabetes,
who have been living in the USA
que han estado viviendo en los EE. UU.
and refugee groups,
de inmigrantes y refugiados,
for obesity and diabetes
de obesidad y diabetes
this issue with two groups
from Southeast Asia:
desde el sudeste asiático:
in the mid-1970s
a mediados de la década de 1970
and the US secret war in Laos;
la guerra secreta de EE. UU. en Laos;
more recently as refugees from Myanmar.
como refugiados de Myanmar.
durante algunos años
communities and clinicians
y sus médicos
to the Hmong and Karen microbiomes
con los microbiomas de Hmong y Karen
and villages in Thailand to the USA.
y las aldeas en Tailandia a EE. UU.
come to the USA from these groups,
de estos grupos viene a EE. UU.
of their microbiome,
and become obese
y se vuelven obesos
un tercio de sus microbios.
mudarse a EE. UU.
a dramatic change in your microbiome,
un cambio dramático en su microbioma,
actually causing the obesity,
están causando la obesidad?
a change in the microbes?
de un cambio en los microbios?
that we're following up on,
ahora en mi laboratorio
from a number of labs around the world
una cantidad de laboratorios del mundo
in the microbiome
en el microbioma
kind of Westernized diseases.
tipo de occidentalización.
your microbiome can actually change.
realmente puede cambiar.
of research happening right now
en la actualidad
how we can restore our microbiomes
cómo restaurar nuestros microbiomas
pasos para nosotros
from healthy people around the world
de personas sanas de todo el mundo
as cultural assets for those groups
como bienes culturales para esos grupos
as they adapt to modern society,
mientras se adaptan a la sociedad moderna,
to have increased risk of these diseases
con un mayor riesgo de estas enfermedades
to restore and replenish our microbiomes,
restaurar y reponer nuestros microbiomas,
will live happier and healthier lives,
vidas más felices y más saludables,
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com