Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
דן נייטס: כיצד אנו חוקרים את החיידקים החיים במערכת העיכול שלכם
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
that's living in your gut,
שחי במערכת העיכול שלכם,
It's the best-known of the gut microbes.
מבין חיידקי מערכת העיכול.
is outnumbered in your gut
עולים עליו במספרם במערכת העיכול שלכם,
you probably haven't heard of.
לבטח לא שמעתם.
Prevotella is another example.
פרבוטלה הוא דוגמה נוספת.
the modern human gut.
האנושית המודרנית.
microbes living inside you.
החיים בתוככם.
living inside you --
if you took a blade of grass
שאם לוקחים פיסת דשא
living in your gut,
שחי במערכת העיכול שלכם,
to life in modern society,
לחיים בחברה המודרנית,
הרגילים שלנו,
related to the gut
in developed nations all around the world.
בכל רחבי העולם.
someone who suffers from obesity,
שסובל מהשמנה,
or ulcerative colitis,
and autoimmunity
למטבוליזם ולאוטואימוניות
of healthy diversity in the gut.
non-human primates.
to a monkey's microbiome
Do they pick up new bugs?
האם הם קולטים חיידקים חדשים?
Does it get better or worse?
האם מצבם משתפר או מחמיר?
species in the jungle,
the DNA from their stool.
מתוך הצואה שלהם.
in my research lab.
במעבדת המחקר שלי.
is that in the wild,
totally different sets of microbes.
שונות לחלוטין של חיידקים.
most of that diversity
את רוב המגוון הזה
some other set of microbes.
השונים האלה.
tropical rainforest
that we're talking about.
that's been burned to the ground
in a captive primate.
are not doing so well.
אינו כל כך טוב.
holding onto their lives.
very interested to find out
that are taking over in the zoo.
שמשתלטים בגן החיות.
and what the DNA told us
by Bacteroides and Prevotella,
על ידי בקטרואידים ופרבוטלה,
in our guts as modern humans.
כבני אדם מודרניים, במערכת העיכול.
from multivariate ecology
מאקולוגיה רבת משתנים
we were studying onto an axis.
שחקרנו על ציר בגרף.
is a distance plot
is a different animal's microbiome.
של חיה אחרת.
a whole zoo of microbes.
גן חיות שלם של חיידקים.
that have a lot of microbes in common
are farther apart.
are over on the left.
highly endangered monkeys
בסכנת הכחדה חמורה
קופי דוק אדומי שוקיים.
are monkeys from Costa Rica.
הם קופים מקוסטה ריקה.
totally different microbiomes in the wild.
מיקרוביום שונה לחלוטין בטבע.
of monkey in the zoo are converging,
much more similar to each other,
on different continents,
and they're eating different diets.
והם ניזונים מדיאטות שונות.
some other species of primate.
do you think is even more divergent
אפילו יותר חורג
than the captive primates?
מאשר הפרימאטים בשבי?
living in developing nations.
from the wild primates
all the way on the right,
כל הדרך מימין,
on the back of my neck,
"Oh, that's interesting,
בדרך להפוך לאמריקאים".
to becoming like Americans."
are like super-captive monkeys.
לקופים סופר-שבויים.
at this figure on my computer screen
שעל מסך המחשב שלי
that four of the red-shanked doucs
שארבעה קופי דוק אדומי שוקיים
למערכת העיכול.
living inside them
to the human part of the story.
as frequently as in the zoo,
of obesity, diabetes,
who have been living in the USA
and refugee groups,
for obesity and diabetes
להשמנת יתר וסוכרת
this issue with two groups
from Southeast Asia:
in the mid-1970s
באמצע שנות השבעים
and the US secret war in Laos;
והמלחמה החשאית האמריקאית בלאוס;
more recently as refugees from Myanmar.
לאחרונה כפליטים ממיאנמר.
communities and clinicians
to the Hmong and Karen microbiomes
של אנשי המונג והקארן
and villages in Thailand to the USA.
וכפרים בתאילנד לארה"ב.
come to the USA from these groups,
of their microbiome,
and become obese
a dramatic change in your microbiome,
במיקרוביום שלכם,
actually causing the obesity,
a change in the microbes?
that we're following up on,
from a number of labs around the world
in the microbiome
kind of Westernized diseases.
של מחלות מערבית מודרניות.
your microbiome can actually change.
יכול למעשה להשתנות.
of research happening right now
how we can restore our microbiomes
את המיקרוביום שלנו
from healthy people around the world
מאנשים בריאים ברחבי העולם
as cultural assets for those groups
כנכסים תרבותיים עבור קבוצות אלה
as they adapt to modern society,
בזמן שהם מסתגלים לחברה המודרנית,
to have increased risk of these diseases
to restore and replenish our microbiomes,
כדי לשחזר ולחדש את המיקרוביום שלנו,
will live happier and healthier lives,
חיים מאושרים ובריאים יותר
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com