Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
Dan Knights: Bağırsağınızda yaşayan mikropları nasıl inceliyoruz
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
that's living in your gut,
mikroplardan birinin adını sorsaydım,
It's the best-known of the gut microbes.
Bağırsak mikroplarımızdan en ünlüsüdür.
is outnumbered in your gut
büyük ihtimalle hiç duymadığınız
you probably haven't heard of.
daha az bulunuyor.
Prevotella is another example.
Prevotella bir başka örnektir.
the modern human gut.
egemen olan ikilidir.
microbes living inside you.
içinizde yaşayan mikrop var.
olarak adlandırırız,
living inside you --
if you took a blade of grass
ot sapı alıp bağırsağınızdaki
living in your gut,
bir tane sap ekseydiniz,
sahasını doldurabilirdi.
to life in modern society,
içerisindeki yaşama uyum sağlarken,
related to the gut
in developed nations all around the world.
birdenbire artmaya başlıyor.
someone who suffers from obesity,
diabet, kron hastalığı,
or ulcerative colitis,
and autoimmunity
hastalıklardan her biri
of healthy diversity in the gut.
yok olmasına bağlıdır.
non-human primates.
araştırıyorduk.
to a monkey's microbiome
hayvanat bahçesine yerleştirilince
bulmak istiyorduk.
Do they pick up new bugs?
Yeni böcekler mi yerleşir?
Does it get better or worse?
Daha iyi ya da kötü mü olur?
species in the jungle,
Costa Rica'da olmak üzere
the DNA from their stool.
DNA'larına baktık.
in my research lab.
böyle inceleriz.
is that in the wild,
totally different sets of microbes.
mikropları olduğuydu.
most of that diversity
bu çeşitliliğin çoğunu kaybedip
some other set of microbes.
tropical rainforest
yaşayan canlı bir
that we're talking about.
çeşitliliklerini kaybetmişler.
that's been burned to the ground
tarafından ele geçirilmiş
in a captive primate.
mikrobiyomuna daha çok benzer.
are not doing so well.
iyi durumda değil.
holding onto their lives.
very interested to find out
bahçelerini ele geçirmiş
that are taking over in the zoo.
ne olduğunu merak ettik.
and what the DNA told us
DNA'nın bize gösterdiği,
by Bacteroides and Prevotella,
yani modern insan olarak
in our guts as modern humans.
bakterilerle dolduğuydu.
from multivariate ecology
ekolojiden aletler kullanarak
we were studying onto an axis.
bir eksene koyduk.
is a distance plot
is a different animal's microbiome.
mikrobiyomunu temsil eder.
a whole zoo of microbes.
mikrop grubunu temsil eder.
that have a lot of microbes in common
mikrobiyomlar birbirlerine
are farther apart.
are over on the left.
sol tarafta olduğunu gösteriyor.
highly endangered monkeys
büyük tehlike altında olan
are monkeys from Costa Rica.
maymunlardır.
totally different microbiomes in the wild.
mikrobiyomları olduğunu görebilirsiniz.
of monkey in the zoo are converging,
hayvanat bahçesinde birleşiyor,
much more similar to each other,
on different continents,
and they're eating different diets.
some other species of primate.
araştırmamış değiliz.
do you think is even more divergent
yakalanmış primatlara göre
than the captive primates?
living in developing nations.
from the wild primates
çok yabani
all the way on the right,
en sağdakiler
on the back of my neck,
"Oh, that's interesting,
"Ah, bu ilginç,
to becoming like Americans."
Amerikalı olma yolundalar."
are like super-captive monkeys.
primatlar gibidir.
at this figure on my computer screen
ekranımdaki figüre bakarken
that four of the red-shanked doucs
bağırsak problemleri yüzünden
living inside them
mikropların olması yaşayıp
to the human part of the story.
insan kısmına getiriyor.
as frequently as in the zoo,
erken ölümlere sebep olmuyor,
of obesity, diabetes,
diabet ve birçok farklı
who have been living in the USA
yaşayanlar için geçerli değil,
sağlıklı gelmiş
and refugee groups,
her bir diğer Amerikalı gibi
for obesity and diabetes
this issue with two groups
Güneydoğu Asya'dan
from Southeast Asia:
in the mid-1970s
ABD'nin gizli Laos savaşından
and the US secret war in Laos;
more recently as refugees from Myanmar.
göçmen olarak gelen Karen'ler.
communities and clinicians
to the Hmong and Karen microbiomes
ve köylerden Amerika'ya giden insanların
and villages in Thailand to the USA.
ortaya çıkan değişimi inceliyorduk.
come to the USA from these groups,
of their microbiome,
and become obese
üçte birini
a dramatic change in your microbiome,
iyi sonuçlanmayacak
actually causing the obesity,
sebep oluyor, yoksa
a change in the microbes?
değişime mi neden oluyor?
that we're following up on,
dünyanın farklı yerlerindeki
from a number of labs around the world
söylediğine göre
in the microbiome
değişiklikler obeziteye
kind of Westernized diseases.
hastalıklara sebep olabiliyor.
your microbiome can actually change.
aslında değişebilir.
of research happening right now
canlı mikroplar kullanarak
how we can restore our microbiomes
düzeltebileceğimizi
from healthy people around the world
sağlıklı insanların mikroplarını,
as cultural assets for those groups
adapte olurken onları koruyacak
as they adapt to modern society,
ve her yeni kuşakla
to have increased risk of these diseases
to restore and replenish our microbiomes,
olacağı ve aynı zamanda
will live happier and healthier lives,
ve sağlıklı yaşayabileceğimiz bir geleceği
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com