Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
دان نايتس: كيف ندرس الميكروبات الحية في الأمعاء
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
that's living in your gut,
يعيش في أمعائكم،
It's the best-known of the gut microbes.
إنها أكثر ميكروبات المعي المعروفة.
is outnumbered in your gut
القولونية عددًَا في أمعائكم
you probably haven't heard of.
والتي لم يسمع معظمكم بالعديد منها
Prevotella is another example.
والبريفوتيلة مثال آخر.
the modern human gut.
على أمعاء الإنسان المعاصر.
microbes living inside you.
تعيش داخلكم.
living inside you --
if you took a blade of grass
إذا أخذتم حفنة من الأعشاب
living in your gut,
to life in modern society,
في المجتمع المعاصر،
related to the gut
in developed nations all around the world.
في البلدان النامية حول العالم.
someone who suffers from obesity,
شخصًا يعاني من البدانة،
or ulcerative colitis,
and autoimmunity
بالاستقلاب والمناعة الذاتية
of healthy diversity in the gut.
non-human primates.
to a monkey's microbiome
للنبيت الميكروبي لدى قرد
Do they pick up new bugs?
هل يلتقطون جراثيم جديدة؟
Does it get better or worse?
هل يتحسنون أم يصبحون أسوء؟
species in the jungle,
the DNA from their stool.
لحمضهم النووي من البراز.
in my research lab.
في مختبري.
is that in the wild,
هو أنه وفي البرية،
totally different sets of microbes.
مجموعتين مختلفتين تمامًا من الميكروبات.
most of that diversity
خسروا معظم هذا التنوع
some other set of microbes.
tropical rainforest
that we're talking about.
that's been burned to the ground
in a captive primate.
لدى الرئيسيات المحتجزة.
are not doing so well.
في حديقة الحيوان.
والإسهال والانتفاخ
holding onto their lives.
على قيد الحياة.
very interested to find out
that are taking over in the zoo.
في حديقة الحيوان.
and what the DNA told us
وما كشفه لنا الحمض النووي
by Bacteroides and Prevotella,
in our guts as modern humans.
في أمعائنا كبشر معاصرين.
from multivariate ecology
من علم البيئة متعدد المتغيرات
we were studying onto an axis.
التي ندرسها في محور واحد.
is a distance plot
is a different animal's microbiome.
لدى حيوان ما.
a whole zoo of microbes.
حديقة حيوان كاملة.
that have a lot of microbes in common
من الميكروبات المشتركة
are farther apart.
are over on the left.
highly endangered monkeys
توجد القردة المهددة بالانقراض
are monkeys from Costa Rica.
توجد القردة من كوستاريكا.
totally different microbiomes in the wild.
نبيتين مختلفين تمامًا في البرية.
of monkey in the zoo are converging,
much more similar to each other,
on different continents,
تقع في قارات مختلفة،
and they're eating different diets.
ولها أنظمة غذائية مختلفة.
some other species of primate.
do you think is even more divergent
أنه أكثر تنوعًا
than the captive primates?
بالمقارنة مع الرئيسيات المحتجزة؟
living in developing nations.
يعيشون في البلدان الناشئة.
from the wild primates
من الرئيسيات البرية
all the way on the right,
في أقصى اليمين،
on the back of my neck,
"Oh, that's interesting,
to becoming like Americans."
لتصبح نوعًا ما كالأمريكيين."
are like super-captive monkeys.
at this figure on my computer screen
على شاشة حاسوبي
that four of the red-shanked doucs
أربعة قردة حمراء الساق
بسبب أمراض متعلقة بالأمعاء
living inside them
to the human part of the story.
في الولايات المتحدة
as frequently as in the zoo,
of obesity, diabetes,
who have been living in the USA
الذين عاشوا في الولايات المتحدة
and refugee groups,
إلى الولايات المتحدة
for obesity and diabetes
بالبدانة والسكري
this issue with two groups
from Southeast Asia:
إلى الولايات المتحدة:
in the mid-1970s
في منتصف السبعينيات
and the US secret war in Laos;
وحرب الولايات المتحدة السرية في لاوس؛
more recently as refugees from Myanmar.
كلاجئين من مينمار.
communities and clinicians
والأطباء السريريين
to the Hmong and Karen microbiomes
لكل من الهمونغ والكارين
and villages in Thailand to the USA.
في تايلاند إلى الولايات المتحدة.
come to the USA from these groups,
إلى الولايات المتحدة،
of their microbiome,
من نبائتهم الميكروبية،
and become obese
ويصبحون بدينين
إلى الولايات المتحدة
a dramatic change in your microbiome,
في نبائتكم الميكروبية،
actually causing the obesity,
a change in the microbes?
that we're following up on,
from a number of labs around the world
حول العالم
in the microbiome
في النبائت الميكروبية
kind of Westernized diseases.
نوع من الأمراض المغرَّبة.
your microbiome can actually change.
يمكن أن تتغير.
of research happening right now
how we can restore our microbiomes
استعادة نبائتنا الميكروبية
from healthy people around the world
من أناس أصحاء حول العالم
as cultural assets for those groups
لهذه المجموعات
as they adapt to modern society,
مع المجتمع المعاصر،
to have increased risk of these diseases
للإصابة بهذه الأمراض
to restore and replenish our microbiomes,
لاستعادة وتجديد نبائتنا الميكروبية،
will live happier and healthier lives,
تعيش القردة حياة أسعد وصحية أكثر،
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com