Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
Dan Knights: Wie wir Mikroben im Darm studieren
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
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that's living in your gut,
einer Mikrobenart, die in ihrem Darm lebt,
wahrscheinlich E.coli sagen.
It's the best-known of the gut microbes.
der bekannteste Mikroorganismus im Darm.
is outnumbered in your gut
ist E.coli im Darm anderen Arten
you probably haven't heard of.
noch nie etwas gehört.
Prevotella is another example.
Ein anderes Beispiel sind Prevotella.
the modern human gut.
modernen menschlichen Darm dominieren.
microbes living inside you.
100 Trillionen Mikroben in uns.
living inside you --
die in uns lebt --
if you took a blade of grass
wenn man für jede Mikrobe,
living in your gut,
einen Grashalm pflanzen würde,
Fußballfelder füllen.
to life in modern society,
in der modernen Gesellschaft anpassen,
unserer normalen Mikroben,
related to the gut
die den Darm betreffen,
in developed nations all around the world.
sprunghaft ansteigen.
someone who suffers from obesity,
jemanden, der unter Fettleibigkeit,
or ulcerative colitis,
oder Colitis ulcerosa,
and autoimmunity
Autoimmunität zusammenhängen,
of healthy diversity in the gut.
Vielfalt von Mikroben im Darm zu tun.
Hinweise darauf,
non-human primates.
Primaten untersuchten.
to a monkey's microbiome
was mit einem Affenmikrobiom geschieht,
in den Zoo gebracht wird.
Do they pick up new bugs?
Haben sie neue Krankheiten?
Does it get better or worse?
Wird es besser oder schlechter?
species in the jungle,
Spezies im Dschungel,
the DNA from their stool.
die DNS aus ihrem Stuhl.
in my research lab.
in unserem Forschungslabor.
is that in the wild,
dass die zwei Arten in der freien Wildbahn
totally different sets of microbes.
von Mikroben hatten.
für die Spezies.
most of that diversity
einen Großteil dieser Vielfalt verloren
some other set of microbes.
tropical rainforest
einen üppigen tropischen Regenwald vor,
that we're talking about.
über die wir hier reden.
that's been burned to the ground
der niedergebrannt wurde und
übernommen wurde.
in a captive primate.
eines Primaten in Gefangenschaft.
im Zoo nicht mehr so gut.
are not doing so well.
Durchfall, Blähungen,
holding onto their lives.
gerade so am Leben.
very interested to find out
sehr daran interessiert, herauszufinden,
that are taking over in the zoo.
die im Zoo übernehmen.
and what the DNA told us
und die verriet uns,
by Bacteroides and Prevotella,
und Prevotella beherrscht wurde,
in our guts as modern humans.
als moderner Mensch in seinem Darm hat.
um das zu visualisieren,
from multivariate ecology
aus der multivariaten Ökologie,
we were studying onto an axis.
auf eine Achse zu bringen.
is a distance plot
is a different animal's microbiome.
eines anderen Tieres darstellt.
a whole zoo of microbes.
einen ganzen Zoo von Mikroben dar.
that have a lot of microbes in common
die viele Mikroben gemeinsam haben,
are farther apart.
liegen weiter auseinander.
are over on the left.
wilden Affen auf der linken Seite sind.
highly endangered monkeys
vom Aussterben bedrohten Affen in Vietnam,
are monkeys from Costa Rica.
totally different microbiomes in the wild.
ganz unterschiedliche Mikrobiome haben.
of monkey in the zoo are converging,
zwei Arten von Affen im Zoo zusammen,
much more similar to each other,
on different continents,
unterschiedlicher Kontinente
und die Affen andere Speisepläne haben.
and they're eating different diets.
some other species of primate.
eine andere Spezies von Primaten.
do you think is even more divergent
divergieren die wilden Primaten
than the captive primates?
den gefangenen Primaten?
living in developing nations.
die in Entwicklungsländern leben.
from the wild primates
von den wilden Primaten
all the way on the right,
die wir untersuchten, ganz rechts,
on the back of my neck,
"Oh, that's interesting,
"Oh, das ist interessant,
to becoming like Americans."
wie Amerikaner zu werden."
are like super-captive monkeys.
in extremer Gefangenschaft sind.
at this figure on my computer screen
auf meinem Computerbildschirm an,
that four of the red-shanked doucs
dass vier rotschenklige Kleideraffen
living inside them
to the human part of the story.
menschlichen Teil der Geschichte.
verursachen offensichtlich
as frequently as in the zoo,
of obesity, diabetes,
an Fettleibigkeit, Diabetes und anderen
who have been living in the USA
in den USA leben,
und Flüchtlinge,
and refugee groups,
Immigranten- und Flüchtlingsgruppen,
for obesity and diabetes
und Diabetes werden
this issue with two groups
mit zwei Gruppen,
from Southeast Asia:
in the mid-1970s
Mitte der 1970er Jahre
and the US secret war in Laos;
und des geheimen US Krieges in Laos kamen;
more recently as refugees from Myanmar.
Flüchtlinge aus Myanmar kommen.
communities and clinicians
und Klinikern zusammen,
to the Hmong and Karen microbiomes
der Hmong und Karen passiert,
and villages in Thailand to the USA.
und Dörfern in Thailand in die USA kommen.
come to the USA from these groups,
in die USA kommen,
of their microbiome,
ihres Mikrobioms verlieren,
and become obese
und fettleibig werden,
a dramatic change in your microbiome,
unseres Mikrobioms hervorzurufen,
actually causing the obesity,
diese Mikroben die Fettleibigkeit,
a change in the microbes?
eine Veränderung in den Mikroben?
that we're following up on,
in unserem Labor haben,
from a number of labs around the world
Labore rund um die Welt,
in the microbiome
Veränderungen in den Mikrobiomen
kind of Westernized diseases.
westlicher Krankheiten führen.
your microbiome can actually change.
dass unser Mikrobiom sich verändern kann.
of research happening right now
eine Menge Forschungarbeiten,
how we can restore our microbiomes
unser Mikrobiom wiederherstellen können,
Schritte für uns ist es,
from healthy people around the world
zu sammeln und zu konservieren,
as cultural assets for those groups
für diese Gruppen aufzubewahren,
as they adapt to modern society,
sie sich an das moderne Leben anpassen,
Generationen zu schützen,
to have increased risk of these diseases
Generation ein höheres Risiko haben,
to restore and replenish our microbiomes,
um unsere Mikrobiome wiederherzustellen
will live happier and healthier lives,
glücklicheres und gesünderes Leben haben.
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com