Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
Dan Knights: Modul în care studiem microbii din intestine
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
that's living in your gut,
care trăieşte în intestinele voastre,
ați spune E. coli.
It's the best-known of the gut microbes.
dintre microbii din intestine.
is outnumbered in your gut
ca număr în intestinele voastre
you probably haven't heard of.
poate nici nu aţi auzit măcar.
Prevotella is another example.
Prevotella este un alt exemplu.
the modern human gut.
intestinele omului modern.
microbes living inside you.
de microbi care trăiesc în voi.
în interiorul vostru,
living inside you --
if you took a blade of grass
că dacă ai lua câte un firicel de iarbă
living in your gut,
care trăieşte în intestine,
de terenuri de fotbal.
to life in modern society,
se adaptează la viaţa societăţii moderne,
related to the gut
in developed nations all around the world.
în naţiunile dezvoltate din lume.
someone who suffers from obesity,
ştiu pe cineva care suferă de obezitate,
or ulcerative colitis,
and autoimmunity
şi de autoimunitate
of healthy diversity in the gut.
a diversităţii sănătoase din intestin.
non-human primates.
primatele non-umane.
to a monkey's microbiome
cu microbiomul unei maimuţe
într-o grădină zoologică.
Do they pick up new bugs?
Dobândesc noi microbi?
Does it get better or worse?
Se face mai bine sau mai rău?
species in the jungle,
diferite din junglă,
the DNA from their stool.
din scaunul lor.
in my research lab.
în laboratorul meu de cercetare.
is that in the wild,
totally different sets of microbes.
seturi de microbi total diferiți.
most of that diversity
în mare parte acea diversitate
some other set of microbes.
tropical rainforest
o pădure tropicală luxuriantă
that we're talking about.
despre care vorbim.
pierd din diversitate.
that's been burned to the ground
care a fost arsă în totalitate
de câteva specii invazive.
in a captive primate.
dintr-o primată în captivitate.
are not doing so well.
nu o duc prea bine.
holding onto their lives.
very interested to find out
that are taking over in the zoo.
ce au pus stăpânire pe grădina zoologică.
and what the DNA told us
iar acesta ne-a spus
by Bacteroides and Prevotella,
in our guts as modern humans.
în intestine ca oameni moderni.
de a vizualiza asta
from multivariate ecology
dintr-o ecologie multivariată
we were studying onto an axis.
pe care le studiam pe o axă.
is a distance plot
is a different animal's microbiome.
un microbiom al unui animal.
a whole zoo of microbes.
o întreagă grădină de microbi.
that have a lot of microbes in common
care au mulţi microbi în comun
are farther apart.
stau mai departe unele de altele.
are over on the left.
sălbatice sunt pe partea stângă
highly endangered monkeys
pe cale de dispariţie
are monkeys from Costa Rica.
din Costa Rica.
totally different microbiomes in the wild.
total diferite în sălbăticie.
of monkey in the zoo are converging,
aceste două specii de maimuţă converg,
much more similar to each other,
una cu cealaltă,
sunt pe continente diferite,
on different continents,
and they're eating different diets.
şi au diete diferite.
some other species of primate.
do you think is even more divergent
că este chiar mai diferită
than the captive primates?
decât primatele în captivitate?
living in developing nations.
în naţiuni în curs de dezvoltare.
from the wild primates
de primatele din sălbăticie
all the way on the right,
la dreapta,
on the back of my neck,
"Oh, that's interesting,
„Oh, e interesant,
to becoming like Americans."
pe cale să devină ca americanii.”
are like super-captive monkeys.
super captive.
at this figure on my computer screen
de pe ecranul calcultatorului meu
that four of the red-shanked doucs
că patru din maimuţele-duk obişnuite
de probleme intestinale.
living inside them
to the human part of the story.
as frequently as in the zoo,
de frecvent precum în grădinile zoologice,
of obesity, diabetes,
de obezitate, diabet,
who have been living in the USA
care trăiesc în SUA
and refugee groups,
de refugiaţi şi de imigranţi,
for obesity and diabetes
de obezitate şi diabet
this issue with two groups
cu două grupuri
from Southeast Asia:
in the mid-1970s
să vină la mijlocul anilor '70
and the US secret war in Laos;
şi războiul secret dus de SUA în Laos;
more recently as refugees from Myanmar.
mai recent ca refugiaţi din Myanmar.
communities and clinicians
to the Hmong and Karen microbiomes
cu microbiomurile Hmong şi Karen
and villages in Thailand to the USA.
şi satele din Thailanda în SUA.
come to the USA from these groups,
din aceste grupuri vin în SUA,
of their microbiome,
din microbiomul lor,
and become obese
să te muţi in SUA
a dramatic change in your microbiome,
dramatică în microbiomul tău,
actually causing the obesity,
a change in the microbes?
o schimbare în flora intestinală?
that we're following up on,
acum în laborator,
from a number of labs around the world
altor câtorva laboratoare din lume,
in the microbiome
kind of Westernized diseases.
într-un fel occidentalizate.
your microbiome can actually change.
se poate schimba.
ceva ce respiră,
of research happening right now
un mare front de cercetare
how we can restore our microbiomes
cum să refacem microbiomurile noastre
from healthy people around the world
de la oameni sănătoşi din toată lumea,
as cultural assets for those groups
ca bunuri culturale pentru aceste grupuri
as they adapt to modern society,
ce se adaptează la societatea modernă
to have increased risk of these diseases
de contractare a acestor boli,
to restore and replenish our microbiomes,
pentru reface și completa microbiomurile,
will live happier and healthier lives,
mai fericite şi mai sănătoase,
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com