Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
دن نایتز: چگونه میکروبهایی که در روده شما زندگی میکنند را مطالعه میکنیم؟
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
that's living in your gut,
که درون روده شما زندگی میکند،
It's the best-known of the gut microbes.
معروفترین میکروب روده است.
is outnumbered in your gut
ای. کولی در روده شما
you probably haven't heard of.
نامشان را هم نشنیدهاید کمتر است.
Prevotella is another example.
و پریوتلا اشاره کرد.
the modern human gut.
بر روده انسان مدرن چیره شدهاند.
microbes living inside you.
درون شما زندگی می کنند.
living inside you --
که درون شما زندگی میکند.
if you took a blade of grass
living in your gut,
درون رودهتان یکی بکارید
زمین فوتبال را پر کنید.
to life in modern society,
در جامعه مدرن سازگار شدهاند،
خود را از دست میدهیم.
related to the gut
in developed nations all around the world.
جهان رشد کردند.
someone who suffers from obesity,
میشناسید که از چاقی مفرط رنج میبرد،
or ulcerative colitis,
and autoimmunity
و خود ایمنی مربوط هستند
of healthy diversity in the gut.
در روده ما مرتبط هستند.
non-human primates.
غیر-انسان مطالعه میکردیم.
to a monkey's microbiome
برای میکروبیوم یک میمون میافتد
Do they pick up new bugs?
یا حشرات جدید میگیرند؟
Does it get better or worse?
وضعشان بهترمیشود یا بدتر؟
species in the jungle,
the DNA from their stool.
از روی مدفوعشان به توالی چیدیم.
in my research lab.
میکروبیوم را مطالعه میکنیم.
is that in the wild,
پیدا کردیم این بود که در حیات وحش،
totally different sets of microbes.
متفاوتی از میکروبها داشتند.
most of that diversity
این تنوع را از دست دادهاند
some other set of microbes.
از میکروبها را پیدا کردند.
tropical rainforest
شاداب گرمسیری را تصور کنید
that we're talking about.
دربارهاش صحبت میکنیم.
that's been burned to the ground
in a captive primate.
در یک نخستیسان اسیر شده وجود دارد.
are not doing so well.
حالشان خوب نیست.
holding onto their lives.
very interested to find out
that are taking over in the zoo.
را تصاحب میکنند چه گونههایی هستند.
and what the DNA told us
چیزی که نشان داد این بود که
by Bacteroides and Prevotella,
in our guts as modern humans.
عنوان انسان، درون روده داریم.
تا این را تجسم کنیم.
from multivariate ecology
چند متغیرهای استفاده کردیم
we were studying onto an axis.
مطالعه میکردیم روی یک محور قرار دهیم.
is a distance plot
نمودار فاصلهای است
is a different animal's microbiome.
متفاوتی را نشان میدهد.
a whole zoo of microbes.
از میکروبهاست.
that have a lot of microbes in common
میکروبهای مشترک زیادی دارند
are farther apart.
متفاوتند از هم جدا هستند.
are over on the left.
highly endangered monkeys
میمونهای در حال انقراض هستند
نامگذاری شدهاند.
are monkeys from Costa Rica.
از کاستاریکا هستند.
totally different microbiomes in the wild.
کاملا متفاوتی در حیات وحش دارند.
of monkey in the zoo are converging,
در باغ وحش همگرا میشوند.
much more similar to each other,
on different continents,
and they're eating different diets.
و رژیم غذایی مختلف هستند.
some other species of primate.
do you think is even more divergent
than the captive primates?
که گرفتار شدهاند، متفاوتتر هستند؟
living in developing nations.
کشورهای درحال توسعه زندگی میکنند.
from the wild primates
هستند که در حیات وحش هستند
all the way on the right,
که در سمت راست است،
on the back of my neck,
"Oh, that's interesting,
آن این بود که: اوه چه جالب.
to becoming like Americans."
تبدیل شدن به آمریکاییها هستند.
are like super-captive monkeys.
at this figure on my computer screen
در کامپیوترم نگاه میکردم
that four of the red-shanked doucs
چهار عدد از دوکهای پا قرمز
در باغ وحش فوت کردهاند.
living inside them
to the human part of the story.
که در ایالات متحده هستند
as frequently as in the zoo,
باعث مرگ نمیشوند،
of obesity, diabetes,
who have been living in the USA
که نسلهای طولانی در آمریکا
and refugee groups,
for obesity and diabetes
در معرض چاقی و دیابت
this issue with two groups
from Southeast Asia:
in the mid-1970s
به عنوان پناهنده
and the US secret war in Laos;
در لائوس به آمریکا آمده؛
more recently as refugees from Myanmar.
پناهنده از میانمار آمدهاند.
communities and clinicians
to the Hmong and Karen microbiomes
میکروبیومهای همونگها و کارنها میافتد،
and villages in Thailand to the USA.
روستاهای تایلند به آمریکا میآیند.
come to the USA from these groups,
از این گروهها به آمریکا میآیند،
of their microbiome,
میکروبیومشان را از دست میدهند،
and become obese
و چاق میشوند
a dramatic change in your microbiome,
در میکروبیوم شما شود،
actually causing the obesity,
باعث چاقی میشوند؟
a change in the microbes?
that we're following up on,
from a number of labs around the world
سراسر جهان وجود دارد
in the microbiome
kind of Westernized diseases.
و تقریبا غربی شده ختم میشوند.
your microbiome can actually change.
در واقع میتواند تغییر میکند.
of research happening right now
از تحقیقات در حال انجام است
how we can restore our microbiomes
میکروبیوهایمان را بازگردانی کنیم
from healthy people around the world
از افراد سالم در سراسر جهان است
as cultural assets for those groups
برای آن گروهها حفظ شوند
as they adapt to modern society,
درحالی که آنها با جامعه مدرن سازگارمیشوند،
to have increased risk of these diseases
به این بیماریها پیدا میکنند.
to restore and replenish our microbiomes,
و احیای میکروبیومهایمان را داشته باشیم،
will live happier and healthier lives,
شادتر و سالمتر زندگی خواهند کرد،
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com