Riccardo Sabatini: How to read the genome and build a human being
ריקרדו סבטיני: כיצד לקרוא את הגנום ולבנות אדם
Riccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
I'm going to take you on a journey
אני הולך לקחת אתכם למסע
the biggest dream of humanity:
של האנושות:
many, many years ago
רבות מאוד.
raw material, some energy,
חומר גלם, אנרגיה מסוימת,
that was not there before.
שלא היה שם קודם.
I was coming back home
always knew a 3D printer.
תמיד הכרתי מדפסת תלת-מימד.
my father and my mom in this case,
אבי ואמי במקרה זה,
in the same media, that is food,
מדיה, זהו מזון.
discovering that she was a 3D printer,
שמגלה שהיא מדפסת 3D,
by that piece,
at the beginning
as a gigantic Lego piece.
כפיסת לגו ענקית.
blocks are little atoms
אטומים קטנים
a carbon here, a nitrogen here.
that compose a human being,
שמרכיבים בן אדם,
quite an astonishing number.
drive to assemble a little baby,
להרכיב תינוק קטן,
of thumb drives --
של כוננים קשיחים,
a pregnant lady,
רואים גברת בהריון,
amount of information
הגדולה ביותר
anything you heard of.
כל מה ששמעתם עליו
of information that exists.
נתונים שקיימת.
than a young physicist,
מפיזיקאי צעיר,
to pack this information
לארוז את המידע הזה
when Rosalind Franklin,
כשרוזלינד פרנקלין,
to finally poke inside a human cell,
לתקוע לבסוף בתוך תא אנושי,
a fairly simple alphabet,
you need three billion of them.
מיליארד מהם.
any sense as a number, right?
הגיוני, נכון?
I could explain myself better
יכולתי להסביר את עצמי טוב יותר
I'm going to have some help,
הולכת להיות לי קצת עזרה,
introduce the code
להציג את הקוד
to sequence it, Dr. Craig Venter.
שערך רצף זה, ד"ר קרייג ונטר.
from the United States to Canada
מארצות הברית לקנדה
Lulu.com, a start-up, did everything.
Lulu.com, חברת סטארט-אפ, עשתה הכל.
of what is the code of life.
של מה הוא הקוד של חיים.
I can do something fun.
אני יכול לעשות משהו מהנה.
book ... like this one.
it's a fairly big book.
זה ספר די גדול.
what is the code of life.
מהו הקוד של החיים.
the color of the eyes to Craig.
את צבע העיניים לקרייג.
more complicated.
יותר מסובך.
two letters in this position --
to a terrible disease:
we don't know how to solve it,
אנחנו לא יודעים לרפא את זה,
of difference from what we are.
מה שהננו.
me, me and you, you --
אותי ואותכם, אותכם --
is the miracle of life that you are.
נס החיים שהוא אתם.
when we think that we are different.
כשאנחנו חושבים שאנחנו שונים.
תשומת הלב שלכם,
at assembling Swedish furniture,
בהרכבת רהיטים שוודיים,
is nothing you can crack in your life.
תוכלו לפצח.
מפורסמים,
לעשות
we can learn from these books,
מן הספרים האלה,
of personalized medicine,
רפואה אישית,
should be done to have better health
כדי לזכות בבריאות טובה יותר
and many, many more people,
הרבה, הרבה יותר אנשים,
called machine learning.
שנקראת למידת מכונה.
thousands of them.
אלפים מהם
the biggest database of human beings:
הנתונים הגדול ביותר של בני אדם:
everything you can think of.
כל מה שאתם יכולים לחשוב עליו.
מנוגדים אלה,
and we train a machine --
ואנחנו מאמנים מכונה
many, many machines --
הרבה, הרבה מכונות --
the genome in a phenotype.
הגנום בפנוטיפ.
and what do they do?
הן עושות?
be used for everything,
is particularly complicated.
זה מסובך במיוחד.
to build different challenges.
לבנות אתגרים שונים.
from common traits.
מתכונות משותפות לכולם.
because they are common,
כי הן נפוצות,
את השאלות שלנו:
and predict your height?
ולחזות את הגובה שלכם?
באורח החיים שלכם,
eight kilograms of precision.
8 קילוגרמים של דיוק.
the code changes during your life.
הקוד משתנה במהלך חייכם.
it gets insertions.
פיסות, מתקבלות תוספות.
עושים מודל.
among millions of these letters.
מיליוני אותיות אלו.
a very well-defined object.
אובייקט מוגדר היטב מאוד.
שלם של זה
a machine what a face is,
מה זה פרצוף,
with machine learning,
למידת מכונה,
we read the first sequence --
את הרצף הראשון --
to see some signals.
אותות.
coming in our lab.
שעולה במעבדה שלנו.
we reduce the complexity,
אנו מפחיתים את מורכבותו,
and asymmetries come from your life.
מגיעים מחייכם.
and we run our algorithm.
ומריצים את האלגוריתם שלנו
ממש כעת
from the blood.
left and right, left and right,
שמאל וימין, ימין ושמאל,
those pictures to be identical.
האלו יהי זהות.
another exercise, to be honest.
תרגיל אחר, אם להיות כנה.
comes from gender,
מגיעה מהמגדר,
the ethnicity component of a human.
הרכיב האתני של אדם.
is much more complicated.
יותר מסובך.
even in the differences,
אפילו בהבדלים,
that we are in the right ballpark,
במגרש הנכון,
that comes in place,
the complete cranial structure,
קיבלנו את מבנה הגולגולת השלם,
in the training of the machine.
באימון של המכונה.
קבוצה ב"השהייה".
probably never believe.
לעולם לא תאמינו.
in a scientific publication,
מדעי,
Chris challenged me.
כריס אתגר אותי.
and tried to predict
וניסיתי לחזות
and believe me, you have no idea
והאמינו לי, אין לכם שום מושג
this blood now, here --
את הדם הזה עכשיו, כאן -
of biological information
של גנום.
and I'm going to do it with you.
לעשות את זה אתכם.
all the understanding we have.
we predicted he's a male.
the subject is 82.
הסובייקט בן 82.
and peculiar ethnicity.
מבחינת מוצא אתני.
they never fit in models.
הם אף פעם לא מתאימים במודלים.
is a complex corner case for our model.
מקרה פינתי מורכב עבור המודל שלנו.
a lot to recognize people
בהם הרבה כדי להכיר אנשים
but my beard cut.
אבל חיתוך הזקן שלי.
in this case, transfer it --
במקרה זה, ולהעביר אותו -
than Photoshop, no modeling --
מפוטושופ, לא דוגמנות --
much, much better in the feeling.
תחושה הרבה יותר טובה.
for predicting height
לניבוי גובה
out of your blood.
and the same approach,
ואותה הגישה,
researchers around the world.
ברחבי העולם.
from a statistical approach
מתוך גישה סטטיסטית
of exactly how you are.
complicated challenge,
אתגר מורכב במיוחד ,
in the world on this topic.
בעולם בנושא זה.
be confronted with decisions
החלטות
לפני כן
inner detail on how life works.
על הדרך בה חיינו עובדים.
that cannot be confined
we're building as a humanity.
שאנחנו בונים כאנושות.
with artists, with philosophers,
עם אמנים, עם פילוסופים,
that we make in the next year
ABOUT THE SPEAKER
Riccardo Sabatini - Scientist, entrepreneurRiccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions.
Why you should listen
Data scientist Riccardo Sabatini harnesses numerical methods for a surprising variety of fields, from material science research to the study of food commodities (as a past director of the EU research project FoodCAST). His most recent research centers on computational genomics and how to crack the code of life.
In addition to his data research, Sabatini is deeply involved in education for entrepreneurs. He is the founder and co-director of the Quantum ESPRESSO Foundation, an advisor in several data-driven startups, and funder of The HUB Trieste, a social impact accelerator.
Riccardo Sabatini | Speaker | TED.com