Riccardo Sabatini: How to read the genome and build a human being
ริคาร์โด ซาบาทินี (Riccardo Sabatini): เราจะอ่านจีโนมและสร้างมนุษย์ได้อย่างไร
Riccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions. Full bio
Double-click the English transcript below to play the video.
I'm going to take you on a journey
ผมกำลังจะพาคุณเดินทางไปด้วยกัน
the biggest dream of humanity:
ที่ยิ่งใหญ่ที่สุดของมวลมนุษยชาติ
many, many years ago
เมื่อหลายปีมาแล้ว
raw material, some energy,
that was not there before.
ที่ไม่ได้ปรากฏอยู่ตรงนั้นแต่แรก
I was coming back home
always knew a 3D printer.
ผมรู้จักเครื่องพิมพ์สามมิติมาโดยตลอด
my father and my mom in this case,
คือระหว่างพ่อและแม่ของผม
in the same media, that is food,
ในบริบทเดียวกันมันคืออาหาร
discovering that she was a 3D printer,
ว่าเธอเป็นเครื่องพิมพ์สามมิติ
by that piece,
at the beginning
as a gigantic Lego piece.
มนุษย์เป็นเลโก้ชิ้นใหญ่ยักษ์
blocks are little atoms
เป็นอะตอมเล็ก ๆ
a carbon here, a nitrogen here.
คาร์บอนตรงนี้ ไนโตรเจนตรงนี้
that compose a human being,
ที่ถูกใช้สร้างมนุษย์ได้
quite an astonishing number.
drive to assemble a little baby,
เพื่อที่จะประกอบเด็กทารกตัวเล็กขึ้นมา
of thumb drives --
a pregnant lady,
หญิงตั้งครรภ์คนนี้
amount of information
ที่มากมายที่สุด
anything you heard of.
ลืมทุกเรื่องที่คุณเคยได้ยิน
of information that exists.
ที่เคยปรากฏอยู่
than a young physicist,
ฉลาดกว่านักฟิสิกส์เด็ก ๆ นัก
to pack this information
มันสามารถอัดข้อมูลนี้
when Rosalind Franklin,
เมื่อ โรสริน แฟรงคลิน
to finally poke inside a human cell,
สามารถมองเข้าไปในเซลล์มนุษย์ได้
a fairly simple alphabet,
ที่ค่อนข้างจะธรรมดาสามัญ
you need three billion of them.
คุณต้องการตัวอักษรนั้นสามพันล้านตัว
any sense as a number, right?
ทำให้เรามองเห็นภาพเลย ใช่ไหมครับ
I could explain myself better
ว่าทำอย่างไรจึงจะอธิบายได้ดีกว่านี้
I'm going to have some help,
ผมกำลังจะขอความช่วยเหลือ
introduce the code
ที่จะมาช่วยผมแนะนำรหัสนี้
to sequence it, Dr. Craig Venter.
ดร. เคร๊ก เวนเตอร์
ขึ้นมาบนเวทีด้วยครับ
from the United States to Canada
ถูกส่งจากสหรัฐฯ ไปแคนาดา
Lulu.com, a start-up, did everything.
สตาร์ทอัพที่ทำทุกอย่าง
of what is the code of life.
ว่ารหัสแห่งชีวิตคืออะไร
I can do something fun.
ที่ผมจะได้ทำอะไรสนุก ๆ
book ... like this one.
อย่างเช่น เล่มนี้
it's a fairly big book.
มันเป็นหนังสือเล่มโต
what is the code of life.
ว่ารหัสแห่งชีวิตมีหน้าตาอย่างไร
ที่ไม่มีความหมายอะไร
the color of the eyes to Craig.
ของหนังสือนี้
more complicated.
two letters in this position --
ในตำแหน่งนี้ --
to a terrible disease:
we don't know how to solve it,
เราไม่รู้ว่าจะต้องจัดการกับมันอย่างไร
of difference from what we are.
ที่ต่างไปจากคนปกติ
ให้คุณได้ชม
me, me and you, you --
ทำให้ผมเป็นผม ทำให้คุณเป็นคุณ --
is the miracle of life that you are.
when we think that we are different.
เมื่อเราคิดว่าเราแตกต่างกัน
at assembling Swedish furniture,
ในการต่อเครื่องเรือนจากสวีเดนสักแค่ไหน
is nothing you can crack in your life.
จะถอดความออกได้ในชั่วชีวิต
we can learn from these books,
จากหนังสือเหล่านี้
of personalized medicine,
เรื่องการแพทย์ส่วนบุคคลให้เป็นจริง
should be done to have better health
เพื่อที่จะให้มีสุขภาพที่ดี
and many, many more people,
และผู้คนอีกมากมาย
called machine learning.
ที่เรียกว่า การเรียนรู้ของเครื่อง (machine learning)
thousands of them.
มากมายเลยทีเดียว
the biggest database of human beings:
ของมนุษย์ ตั้งแต่
everything you can think of.
ทุกอย่างที่เราจะนึกออก
and we train a machine --
many, many machines --
the genome in a phenotype.
ให้เป็นฟีโนไทป์
and what do they do?
be used for everything,
is particularly complicated.
ค่อนข้างที่จะซับซ้อนเป็นพิเศษ
to build different challenges.
และเราต้องการที่จะสร้างความท้าทายใหม่
from common traits.
because they are common,
เพราะว่าพวกมันเป็นสิ่งที่พบทั่วไป
and predict your height?
และคาดเดาส่วนสูงของคุณได้ไหม
กับการใช้ชีวิตของคุณ
eight kilograms of precision.
ที่ระดับความแม่นยำแปดกิโลกรัม
the code changes during your life.
ในช่วงต่าง ๆ ของชีวิตของคุณ
it gets insertions.
มันมีส่วนที่ถูกแทรกเข้าไป
among millions of these letters.
อยู่ท่ามกลางตัวหนังสือนับล้านเหล่านี้
a very well-defined object.
ก็ไม่ใช่สิ่งที่ถูกกำหนดไว้อย่างชัดเจน
ระดับต่าง ๆ ทั้งหมดสำหรับมัน
a machine what a face is,
with machine learning,
we read the first sequence --
15 ปีหลังจากที่เราอ่านลำดับแรกได้ --
to see some signals.
เราเริ่มที่จะเห็นสัญญาณบางอย่าง
coming in our lab.
we reduce the complexity,
เราลดความซับซ้อนลง
and asymmetries come from your life.
ที่เกิดขึ้นในชีวิตประจำวัน
and we run our algorithm.
from the blood.
left and right, left and right,
แล้วก็ซ้ายแล้วก็ขวา
those pictures to be identical.
ก็ต้องการให้ภาพนั้นเหมือนกัน
another exercise, to be honest.
comes from gender,
the ethnicity component of a human.
และองค์ประกอบเชื้อชาติของมนุษย์
is much more complicated.
เป็นอะไรที่ซับซ้อนกว่ามาก
even in the differences,
แม้ว่ามันจะมีความแตกต่าง
that we are in the right ballpark,
ว่าเราได้ภาพคร่าว ๆ ที่ถูกต้อง
that comes in place,
the complete cranial structure,
เราไม่ได้เห็นโครงสร้างกระโหลกที่สมบูรณ์
in the training of the machine.
ในการสอนเครื่อง
probably never believe.
in a scientific publication,
ในวารสารทางวิทยาศาสตร์
Chris challenged me.
and tried to predict
and believe me, you have no idea
และเชื่อผมเหอะ คุณไม่รู้หรอกว่า
this blood now, here --
แต่เอาล่ะ --
of biological information
and I'm going to do it with you.
all the understanding we have.
we predicted he's a male.
เราคาดคะเนได้ว่า เขาเป็นผู้ชาย
กับ 76 เซนติเมตร
กับอีก 77 เซนติเมตร
the subject is 82.
ตัวอย่างของเรามีน้ำหนัก 82
and peculiar ethnicity.
และค่อนข้างจะแปลก
they never fit in models.
มันไม่เข้ากับแบบจำลองครับ
is a complex corner case for our model.
เป็นกรณีที่สร้างความซับซ้อนให้กับแบบจำลอง
a lot to recognize people
มันเป็นหน้าตาของผม
but my beard cut.
แต่เป็นลักษณะของหนวดเครา
in this case, transfer it --
ในกรณีนี้ ผมจะย้ายมัน --
than Photoshop, no modeling --
การทำโฟโตช๊อป ไม่มีทำแบบจำลอง --
much, much better in the feeling.
เราได้ความรู้สึกที่ดีกว่ามาก ๆ
for predicting height
เพื่อคาดคะเนความสูง
out of your blood.
and the same approach,
และวิธีการเดียวกันนี้
researchers around the world.
from a statistical approach
ที่จะเปลี่ยนจากวิธีทางสถิติ
of exactly how you are.
ว่าเรานั้นจริง ๆ แล้วเป็นอย่างไร
complicated challenge,
in the world on this topic.
be confronted with decisions
inner detail on how life works.
ว่าชีวิตนั้นเป็นเช่นใด
that cannot be confined
we're building as a humanity.
ที่เรากำลังสร้างในฐานะมนุษยชาติ
with artists, with philosophers,
กับศิลปิน กับนักปรัชญา
that we make in the next year
ABOUT THE SPEAKER
Riccardo Sabatini - Scientist, entrepreneurRiccardo Sabatini applies his expertise in numerical modeling and data to projects ranging from material science to computational genomics and food market predictions.
Why you should listen
Data scientist Riccardo Sabatini harnesses numerical methods for a surprising variety of fields, from material science research to the study of food commodities (as a past director of the EU research project FoodCAST). His most recent research centers on computational genomics and how to crack the code of life.
In addition to his data research, Sabatini is deeply involved in education for entrepreneurs. He is the founder and co-director of the Quantum ESPRESSO Foundation, an advisor in several data-driven startups, and funder of The HUB Trieste, a social impact accelerator.
Riccardo Sabatini | Speaker | TED.com