TEDMED 2012
Jonathan Eisen: Meet your microbes
Jonathan Eisen : faites connaissance avec vos microbes
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Nos corps sont recouverts d'une mer de microbes, à la fois pathogènes qui nous rendent malades et les "bons" microbes, que nous connaissons moins bien, qui pourraient nous garder en bonne santé. A TEDMED, le microbiologiste Jonathan Eisen partage ce que nous savons, y compris des façons surprenantes de faire travailler les bons microbes.
Jonathan Eisen - Biologist
Jonathan Eisen studies the ecology and evolution of microbial communities -- and their co-evolution with their hosts. Full bio
Jonathan Eisen studies the ecology and evolution of microbial communities -- and their co-evolution with their hosts. Full bio
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I'm going to start with a little story.
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1455
Je vais commencer par une petite histoire.
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So, I grew up in this neighborhood. When I was 15 years old,
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3112
Donc, j'ai grandi dans ce quartier. Quand j'avais 15 ans,
00:17
I went from being what I think was a strapping young athlete,
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5204
4551
j'ai cessé d'être ce que je pense que j'étais, un jeune athlète costaud,
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over four months, slowly wasting away until
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en quatre mois, je me suis étiolé lentement
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I was basically a famine victim
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13716
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jusqu'à ce que je sois en gros victime de famine
00:27
with an unquenchable thirst.
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2024
avec une soif inextinguible.
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I had basically digested away my body.
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3609
En gros, j''avais digéré mon corps.
00:33
And this all came to a head when I was on a backpacking trip,
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4294
Et tout ça a atteint un paroxysme quand j'étais en randonnée,
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my first one ever actually, on Old Rag Mountain
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2045
ma première randonnée en fait, sur Old Rag Mountain
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in West Virginia, and was putting my face into puddles
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3984
en Virginie Occidentale et que je mettais mon visage dans des flaques d'eau
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of water and drinking like a dog.
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et je buvais comme un chien.
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That night, I was taken into the emergency room
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4512
Cette nuit-là, j'ai été emmené aux urgences
00:50
and diagnosed as a type 1 diabetic in full-blown ketoacidosis.
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38328
3881
et diagnostiqué comme diabétique de type 1 en pleine crise d'acidocétose.
00:54
And I recovered, thanks to the miracles of modern medicine,
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42209
5935
Et j'ai récupéré, grâce aux miracles de la médecine moderne,
01:00
insulin and other things, and gained all my weight back and more.
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48144
5456
l'insuline et d'autres choses et je suis revenu à mon poids initial, et je l'ai même dépassé.
01:05
And something festered inside me after this happened.
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53600
5511
Et quelque chose a pourri à l'intérieur de moi après ça.
01:11
What I thought about was, what caused the diabetes?
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3513
Ce à quoi je pensais c'était, qu'est-ce qui a provoqué le diabète ?
01:14
You see, diabetes is an autoimmune disease
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62624
1853
Vous voyez, le diabète est une maladie auto-immune
01:16
where your body fights itself, and at the time people thought
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3375
où votre corps se combat lui-même et à l'époque les gens pensaient que
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that somehow maybe exposure to a pathogen
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3041
peut-être, d'une certaine façon, l'exposition à un agent pathogène
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had triggered my immune system to fight the pathogen
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70893
4472
avait déclenché mon système immunitaire pour qu'il lutte contre l'agent pathogène
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and then kill the cells that make insulin.
21
75365
2058
et puis tue les cellules qui fabriquent l'insuline.
01:29
And this is what I thought for a long period of time,
22
77423
2310
Et c'est ce que j'ai pensé pendant longtemps,
01:31
and that's in fact what medicine and people have focused on quite a bit,
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79733
4048
et c'est en fait ce sur quoi la médecine et les gens ont continué à se concentrer,
01:35
the microbes that do bad things.
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83781
2922
les microbes qui font du mal.
01:38
And that's where I need my assistant here now.
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86703
3068
Et c'est là que j'ai besoin de mon assistante.
01:41
You may recognize her.
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89771
2438
Vous la reconnaissez peut-être.
01:44
So, I went yesterday, I apologize, I skipped a few of the talks,
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92209
5680
Donc, je suis allé hier, je m'en excuse, j'ai séché quelques conférences,
01:49
and I went over to the National Academy of Sciences building,
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97889
2241
et je suis allé à la National Academy of Sciences,
01:52
and they sell toys, giant microbes.
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100130
5447
et ils vendent des jouets, des microbes géants.
01:57
And here we go!
30
105577
3385
Et c'est parti !
02:00
So you have caught flesh-eating disease if you caught that one.
31
108962
4755
Vous avez attrapé la maladie mangeuse de chair si vous avvez attrapé celui-là.
02:05
I gotta get back out my baseball ability here.
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113717
4428
Il faut que je retrouve mes aptitudes au baseball ici.
02:10
(Laughter)
33
118145
3707
(Rires)
02:13
So, unfortunately or not surprisingly, most of the microbes
34
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6381
Donc, c'est malheureux ou ce n'est pas étonnant, la plupart des microbes
02:20
they sell at the National Academy building are pathogens.
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128233
3343
qu'ils vendent à la National Academy sont des agents pathogènes.
02:23
Everybody focuses on the things that kill us,
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131576
2969
Tout le monde se concentre sur les choses qui nous tuent,
02:26
and that's what I was focusing on.
37
134545
1647
et c'est ce sur quoi je me concentrais .
02:28
And it turns out that we are covered in a cloud of microbes,
38
136192
4561
Et il s'avère que nous sommes couverts d'un nuage de microbes,
02:32
and those microbes actually do us good much of the time,
39
140753
4520
et ces microbes nous font du bien la plupart du temps,
02:37
rather than killing us.
40
145273
1120
plutôt que de nous tuer.
02:38
And so, we've known about this for some period of time.
41
146393
3191
Et donc, nous le savons depuis un certain temps.
02:41
People have used microscopes to look at the microbes that cover us,
42
149584
3577
Les gens ont utilisé des microscopes pour observer les microbes qui nous recouvre,
02:45
I know you're not paying attention to me, but ...
43
153161
1792
je sais que vous ne faites pas attention à moi, mais...
02:46
(Laughter)
44
154953
2098
(Rires)
02:49
The microbes that cover us.
45
157051
1942
Les microbes qui nous recouvrent.
02:50
And if you look at them in the microscope,
46
158993
3160
Et si vous les regardez au microscope,
02:54
you can see that we actually have 10 times as many cells
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162153
3404
vous pouvez voir que nous avons en fait 10 fois plus de cellules
02:57
of microbes on us as we have human cells.
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165557
3468
de microbes sur nous que de cellules humaines.
03:01
There's more mass in the microbes than the mass of our brain.
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169025
4751
La masse de microbes et supérieure à la masse de notre cerveau.
03:05
We are literally a teeming ecosystem of microorganisms.
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173776
4321
Nous sommes littéralement un écosystème qui grouille de micro-organismes.
03:10
And unfortunately, if you want to learn about the microorganisms,
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178097
4600
Et malheureusement, si vous voulez en savoir plus sur les micro-organismes,
03:14
just looking at them in a microscope is not sufficient.
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182697
2280
il ne suffit pas de les regarder au microscope.
03:16
And so we just heard about the DNA sequencing.
53
184977
2580
Et donc nous venons d'entendre parler du séquençage de l'ADN.
03:19
It turns out that one of the best ways to look at microbes
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187557
2528
Il s'avère que l'une des meilleures façons de regarder les microbes
03:22
and to understand them is to look at their DNA.
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190085
2536
et de les comprendre est de regarder leur ADN.
03:24
And that's what I've been doing for 20 years,
56
192621
2142
Et c'est ce que j'ai fait depuis 20 ans,
03:26
using DNA sequencing, collecting samples from various places,
57
194763
3882
à l'aide du séquençage de l'ADN, en recueillant des échantillons de divers endroits,
03:30
including the human body, reading the DNA sequence
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198645
2904
y compris le corps humain, en lisant la séquence d'ADN
03:33
and then using that DNA sequencing to tell us about
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201549
2620
et puis en utilisant le séquençage de l'ADN pour nous parler
03:36
the microbes that are in a particular place.
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204169
2166
des microbes qui se trouvent dans un endroit particulier.
03:38
And what's amazing, when you use this technology,
61
206335
2863
Et ce qui est étonnant, lorsque vous utilisez cette technologie,
03:41
for example, looking at humans, we're not just covered
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209198
3160
par exemple, si l'on considère les êtres humains, nous ne sommes pas seulement couvert
03:44
in a sea of microbes.
63
212358
1136
d'une mer de microbes.
03:45
There are thousands upon thousands of different kinds of microbes on us.
64
213494
5111
Il y a des milliers d'espèces différentes de microbes sur nous.
03:50
We have millions of genes of microbes in our human
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218605
5353
Nous avons des millions de gènes de microbes
03:55
microbiome covering us.
66
223958
1647
dans notre microbiome humain qui nous recouvrent.
03:57
And so this microbial diversity differs between people,
67
225605
3505
Et donc cette diversité microbienne diffère d'une personne à l'autre,
04:01
and what people have been thinking about in the last 10,
68
229110
3136
et ce à quoi les gens ont pensé ces 10, peut-être 15
04:04
maybe 15 years is, maybe these microbes,
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232246
3120
dernières années c'est que ces microbes,
04:07
this microbial cloud in and on us,
70
235366
2048
ce nuage microbien en nous et sur nous,
04:09
and the variation between us, may be responsible
71
237414
3880
et les variations entre nous, sont peut-être responsables
04:13
for some of the health and illness differences between us.
72
241294
3570
des différences de santé et de maladie entre nous.
04:16
And that comes back to the diabetes story I was telling you.
73
244864
3123
Et ça nous ramène à l'histoire du diabète que je vous racontais.
04:19
It turns out that people now think that one of the triggers
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247987
3406
Il s'avère que les gens pensent maintenant que l'un des déclencheurs
04:23
for type 1 diabetes is not fighting a pathogen,
75
251393
2381
du diabète de type 1 n'est pas la lutte contre un agent pathogène,
04:25
but is in fact trying to -- miscommunicating with the microbes
76
253774
4391
mais est en fait la tentative de lutte, une communication défaillante avec les microbes
04:30
that live in and on you.
77
258165
1497
qui vivent dans et sur vous.
04:31
And somehow maybe the microbial community that's
78
259662
2704
Et d'une certaine façon peut-être que la communauté microbienne
04:34
in and on me got off, and then this triggered some sort
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262366
4033
qui est en moi et sur moi, et ensuite ça a déclenché une sorte
04:38
of immune response and led to me killing the cells
80
266399
2239
de réponse immunitaire et la conduit à ce que je tue les cellules
04:40
that make insulin in my body.
81
268638
2221
qui fabriquent l'insuline dans mon corps.
04:42
And so what I want to tell you about for a few minutes is,
82
270859
3096
Et c'est ce dont je veux vous parler pendant quelques minutes,
04:45
what people have learned using DNA sequencing techniques
83
273955
3792
ce que les gens ont appris à l'aide des techniques de séquençage ADN
04:49
in particular, to study the microbial cloud
84
277747
3659
en particulier, pour étudier le nuage microbien
04:53
that lives in and on us.
85
281406
1574
qui vit en nous et sur nous.
04:54
And I want to tell you a story about a personal project.
86
282980
2464
Et je veux vous parler d'un projet personnel.
04:57
My first personal experience with studying the microbes
87
285444
2794
Ma première expérience personnelle avec l'étude des microbes
05:00
on the human body actually came from a talk that I gave,
88
288238
4150
sur le corps humain vient en fait d'une conférence que j'ai donnée,
05:04
right around the corner from here at Georgetown.
89
292388
1800
à deux pas d'ici à Georgetown.
05:06
I gave a talk, and a family friend who happened to be
90
294188
3017
J'ai donné une conférence et un ami de la famille qui se trouvait
05:09
the Dean of Georgetown Medical School was at the talk,
91
297205
2543
être le Doyen de Georgetown Medical School assistait à la Conférence,
05:11
and came up to me afterwards saying, they were doing
92
299748
2490
et est venu me dire par la suite qu'ils faisaient
05:14
a study of ileal transplants in people.
93
302238
3350
une étude des greffes iléales chez les gens.
05:17
And they wanted to look at the microbes after the transplants.
94
305588
3976
Et ils voulaient observer les microbes après la greffe.
05:21
And so I started a collaboration with this person,
95
309564
3064
Et j'ai donc commencé une collaboration avec cette personne,
05:24
Michael Zasloff and Thomas Fishbein, to look at the microbes
96
312628
3273
Michael Zasloff et Thomas Fishbein, pour observer les microbes
05:27
that colonized these ilea after they were transplanted into a recipient.
97
315901
4473
qui colonisaient ces ilea après qu'on les ait greffés sur quelqu'un.
05:32
And I can tell you all the details about the microbial study
98
320374
3142
Et je peux vous dire tous les détails de l'étude microbienne
05:35
that we did there, but the reason I want to tell you this story
99
323516
2250
que nous avons faite, mais la raison pour laquelle que je tiens à vous raconter cette histoire
05:37
is something really striking that they did at the beginning
100
325766
3224
est une chose vraiment frappante qu'ils l'ont fait au début
05:40
of this project.
101
328990
1023
de ce projet.
05:42
They take the donor ileum, which is filled with microbes from a donor
102
330013
4365
Ils prennent l'iléon d'un donneur, qui est plein des microbes du donneur
05:46
and they have a recipient who might have a problem
103
334378
2283
et ils ont un bénéficiaire qui pourrait avoir un problème
05:48
with their microbial community, say Crohn's disease,
104
336661
2625
avec sa communauté microbienne, disons la maladie de Crohn,
05:51
and they sterilized the donor ileum.
105
339286
3560
et ils stérilisent l'iléon du donneur.
05:54
Cleaned out all the microbes, and then put it in the recipient.
106
342846
4295
Ils ont nettoyé tous les microbes et ensuite greffé le patient.
05:59
They did this because this was common practice
107
347141
2664
Ils ont fait cela parce que c'était une pratique courante
06:01
in medicine, even though it was obvious
108
349805
3129
en médecine, même s'il était évident
06:04
that this was not a good idea.
109
352934
2138
que ce n'était pas une bonne idée.
06:07
And fortunately, in the course of this project,
110
355072
3005
Et heureusement, dans le cadre de ce projet,
06:10
the transplant surgeons and the other people
111
358077
2563
les chirurgiens transplantologues et les autres personnes
06:12
decided, forget common practice. We have to switch.
112
360640
4421
ont décidé d'oublier la pratique courante. Nous devons passer à autre chose..
06:17
So they actually switched to leaving some of the microbial
113
365061
4145
Donc ils sont en fait passés à laisser une partie de la communauté microbienne
06:21
community in the ileum. They leave the microbes with the donor,
114
369206
4000
dans l'iléon. Ils laissent les microbes du donneur,
06:25
and theoretically that might help the people who are
115
373206
3576
et théoriquement, ça pourrait aider les personnes qui reçoivent
06:28
receiving this ileal transplant.
116
376782
2089
cette greffe iléale.
06:30
And so, people -- this is a study that I did now.
117
378871
3302
Et les gens, c'est donc une étude que j'ai faite.
06:34
In the last few years there's been a great expansion
118
382173
2305
Au cours des dernières années, il y a eu une grande expansion
06:36
in using DNA technology to study the microbes in and on people.
119
384478
4178
de l'utilisation de la technologie de l'ADN pour l'étude des microbes dans et sur les gens.
06:40
There's something called the Human Microbiome Project
120
388656
1808
Il y a quelque chose appelé le Projet Microbiome Humain
06:42
that's going on in the United States,
121
390464
1856
en ce moment aux États-Unis,
06:44
and MetaHIT going on in Europe, and a lot of other projects.
122
392320
2534
et MetaHIT en Europe et beaucoup d'autres projets en cours.
06:46
And when people have done a variety of studies,
123
394854
3189
Et quand les gens ont fait diverses d'études,
06:50
they have learned things such as, when a baby is
124
398043
3632
ils ont appris des choses, par exemple, quand un bébé nait
06:53
born, during vaginal delivery you get colonized by the
125
401675
2984
au cours de l'accouchement par voie basse, il est colonisé
06:56
microbes from your mother.
126
404659
1192
par les microbes de sa mère.
06:57
There are risk factors associated with cesarean sections,
127
405851
3056
Il y a des facteurs de risque associés aux césariennes,
07:00
some of those risk factors may be due to mis-colonization
128
408907
4031
certains de ces facteurs de risque peuvent être dus à la mauvaise colonisation
07:04
when you carve a baby out of its mother
129
412938
2392
lorsqu'on extrait un bébé de sa mère par césarienne
07:07
rather than being delivered through the birth canal.
130
415330
2825
plutôt que de pratiquer un accouchement par voie naturelle.
07:10
And a variety of other studies have shown that the
131
418155
3449
Et diverses autres études ont montré que la
07:13
microbial community that lives in and on us
132
421604
1807
communauté microbienne qui vit en nous et sur nous
07:15
helps in development of the immune system,
133
423411
2263
contribue au développement du système immunitaire,
07:17
helps in fighting off pathogens, helps in our metabolism,
134
425674
4945
à repousser les agents pathogènes, à notre métabolisme,
07:22
and determining our metabolic rate, probably
135
430619
3080
et en déterminant notre métabolisme, elle détermine probablement
07:25
determines our odor, and may even shape our behavior
136
433699
3175
notre odeur et peut même influencer notre comportement
07:28
in a variety of ways.
137
436874
1936
de diverses façons.
07:30
And so, these studies have documented or suggested
138
438810
3056
Et donc, ces études ont documenté ou suggéré
07:33
out of a variety of important functions for the microbial community,
139
441866
4287
à partir de diverses fonctions importantes pour la communauté microbienne,
07:38
this cloud, the non-pathogens that live in and on us.
140
446153
4537
ce nuage, les non-pathogènes qui vivent dans et sur nous.
07:42
And one area that I think is very interesting,
141
450690
3584
Et un domaine que je pense très intéressant,
07:46
which many of you may have now that we've thrown
142
454274
2666
et que plusieurs d'entre vous peuvent avoir maintenant que nous avons jeté
07:48
microbes into the crowd, is something that I would call "germophobia."
143
456940
3930
des microbes dans la foule, est une chose que j'appellerais « la germophobie. »
07:52
So people are really into cleanliness, right?
144
460870
2959
Les gens sont vraiment fans de propreté, non ?
07:55
We have antibiotics in our kitchen counters,
145
463829
1979
Nous avons des antibiotiques dans nos tiroirs de cuisine,
07:57
people are washing every part of them all of the time,
146
465808
3096
les gens se lavent tout, tout le temps,
08:00
we pump antibiotics into our food, into our communities,
147
468904
5026
nous injectons des antibiotiques dans notre nourriture, dans nos communautés,
08:05
we take antibiotics excessively.
148
473930
2441
nous prenons des antibiotiques de manière excessive.
08:08
And killing pathogens is a good thing if you're sick,
149
476371
3839
Et tuer les agents pathogènes est une bonne chose si on est malade,
08:12
but we should understand that when we pump chemicals
150
480210
3264
mais nous devons comprendre que lorsque nous injections des produits chimiques
08:15
and antibiotics into our world, that we're also killing
151
483474
2897
et des antibiotiques dans notre monde, que nous tuons aussi
08:18
the cloud of microbes that live in and on us.
152
486371
2295
le nuage de microbes qui vivent dans et sur nous.
08:20
And excessive use of antibiotics, in particular in children,
153
488666
3000
Et l'utilisation excessive des antibiotiques, en particulier chez les enfants,
08:23
has been shown to be associated with, again, risk factors
154
491666
3229
s'est avérée associée, une fois de plus, aux facteurs de risque
08:26
for obesity, for autoimmune diseases, for a variety
155
494895
4256
de l'obésité, des maladies auto-immunes, pour divers
08:31
of problems that are probably due to disruption
156
499151
1904
problèmes qui sont probablement dus à des perturbations
08:33
of the microbial community.
157
501055
3104
de la communauté microbienne.
08:36
So the microbial community can go wrong
158
504159
3352
La communauté microbienne peut donc mal tourner
08:39
whether we want it to or not,
159
507511
1712
que nous le voulions ou non,
08:41
or we can kill it with antibiotics,
160
509223
2248
ou nous pouvons la tuer avec des antibiotiques,
08:43
but what can we do to restore it?
161
511471
2096
mais que pouvons-nous faire pour la restaurer ?
08:45
I'm sure many people here have heard about probiotics.
162
513567
3112
Je suis certain que beaucoup de gens ont entendu parler des probiotiques.
08:48
Probiotics are one thing that you can try and do to restore
163
516679
3008
Les probiotiques sont une chose que vous pouvez essayer pour restaurer
08:51
the microbial community that is in and on you.
164
519687
2424
la communauté microbienne qui est en vous et sur vous.
08:54
And they definitely have been shown to be effective in some cases.
165
522111
3472
Et ils se sont certainement montrés efficace dans certains cas.
08:57
There's a project going on at UC Davis where people are using
166
525583
3097
Il y a un projet en cours à UC Davis, où les gens utilisent
09:00
probiotics to try and treat, prevent,
167
528680
2895
des probiotiques pour essayer de traiter, de prévenir,
09:03
necrotizing enterocolitis in premature infants.
168
531575
2512
l'entérocolite nécrosante chez les prématurés.
09:06
Premature infants have real problems with their microbial community.
169
534087
3408
Les prématurés ont de réels problèmes avec leur communauté microbienne.
09:09
And it may be that probiotics can help prevent
170
537495
2520
Et il est possible que les probiotiques puissent contribuer à prévenir
09:12
the development of this horrible necrotizing enterocolitis
171
540015
3136
le développement de cette horrible entérocolite nécrosante
09:15
in these premature infants.
172
543151
1665
chez ces prématurés.
09:16
But probiotics are sort of a very, very simple solution.
173
544816
3991
Mais les probiotiques sont une solution très simple.
09:20
Most of the pills that you can take or the yogurts that you can eat
174
548807
3355
La plupart des pilules que vous pouvez prendre ou les yaourts que vous pouvez manger
09:24
have one or two species in them, maybe five species in them,
175
552162
4787
contiennent une ou deux espèces, peut-être cinq espèces
09:28
and the human community is thousands upon thousands of species.
176
556949
3666
et la communauté humaine représente des milliers et des milliers d'espèces.
09:32
So what can we do to restore our microbial community
177
560615
3928
Que pouvons-nous faire pour restorer notre communauté microbienne
09:36
when we have thousands and thousands of species on us?
178
564543
3199
quand nous avons des milliers et des milliers d'espèces sur nous ?
09:39
Well, one thing that animals seem to do is,
179
567742
2706
Eh bien, une chose que les animaux semblent faire,
09:42
they eat poo -- coprophagia.
180
570448
4014
ils mangent les matières fécales, c'est la coprophagie.
09:46
And it turns out that many veterinarians,
181
574462
4609
Et il s'avère que de nombreux vétérinaires,
09:51
old school veterinarians in particular,
182
579071
2009
surtout de l'ancienne école,
09:53
have been doing something called "poo tea,"
183
581080
2716
font ce qu'on appelle du « thé de bouse»
09:55
not booty, but poo tea, to treat colic and other
184
583796
5805
pour traiter les coliques et autres maladies
10:01
ailments in horses and cows and things like that,
185
589601
3623
chez les chevaux et les vaches et d'autres animaux,
10:05
where you make tea from the poo from a healthy
186
593224
3948
où vous faites une infusion avec la bouse d'un animal sain
10:09
individual animal and you feed it to a sick animal.
187
597172
3149
et vous la donnez à un animal malade.
10:12
Although, unless you have a fistulated cow with a big hole in its side,
188
600321
4440
Quoique, à moins d'avoir une vache fistulée avec un gros trou dans son côté,
10:16
and you can put your hand into its rumen,
189
604761
2539
et que vous pouvez mettre votre main dans sa panse,
10:19
it's hard to imagine that the delivery of microbes
190
607300
3408
il est difficile d'imaginer que l'apport des microbes
10:22
directly into the mouth and through the entire
191
610708
2929
directement par la bouche et à travers
10:25
top of the digestive tract is the best delivery system,
192
613637
3648
tout le système digestif soit le meilleur mode d'administration,
10:29
so you may have heard in people they are now doing
193
617285
4120
donc vous avez peut-être entenduque chez les personnes, ion fait maintenant
10:33
fecal transplants, where rather than delivering
194
621405
4650
des transplantations fécales, où, plutôt que d'introduire
10:38
a couple of probiotic microbes through the mouth,
195
626055
2432
quelques microbes probiotiques par la bouche,
10:40
they are delivering a community of probiotics,
196
628487
3453
on introduit une communauté de probiotiques,
10:43
a community of microbes from a healthy donor,
197
631940
2480
une communauté de microbes provenant d'un donneur sain,
10:46
through the other end.
198
634420
2137
par l'autre extrémité.
10:48
And this has turned out to be very effective in fighting
199
636557
3330
Et cela s'est avéré très efficace dans la lutte contre
10:51
certain intransigent infectious diseases
200
639887
2366
certaines maladies infectieuses graves
10:54
like Clostridium difficile infections that can stay
201
642253
3839
comme les infections digestives à Clostridium difficile que les gens
10:58
with people for years and years and years.
202
646092
2097
peuvent garder pendant des années, des années et des années.
11:00
Transplants of the feces, of the microbes from the feces,
203
648189
4863
La transplantation des fèces, des microbes des fèces,
11:05
from a healthy donor has actually been shown to cure
204
653052
2865
provenant d'un donneur sain a été prouvés'est avérée efficace pour guérir
11:07
systemic C. dif infections in some people.
205
655917
2861
des infections à clostridium difficile chez certaines personnes.
11:10
Now what these transplants, these fecal transplants, or
206
658778
5842
Ce que ces transplantations, ces transplantations fécales, ou
11:16
the poo tea suggest to me, and many other people
207
664620
4459
le thé de bouse me donnent à penser, et bien d'autres personnes
11:21
have come up with this same idea, is that
208
669079
1744
ont eu cette même idée, c'est que
11:22
the microbial community in and on us, it's an organ.
209
670823
3888
la communauté microbienne dans et sur nous, c'est un organe.
11:26
We should view it as a functioning organ, part of ourselves.
210
674711
5007
Nous devons le considérer comme un organe en fonctionnement, une partie de nous-mêmes.
11:31
We should treat it carefully and with respect,
211
679718
3991
Nous devons la traiter avec soin et respect,
11:35
and we do not want to mess with it, say by C-sections
212
683709
3980
et nous ne voulons pas l'abîmer, par exemple par des césariennes,
11:39
or by antibiotics or excessive cleanliness,
213
687689
4908
ou des antibiotiques ou une propreté excessive,
11:44
without some real good justification.
214
692597
3217
sans vraie bonne raison.
11:47
And what the DNA sequencing technologies are allowing people to do now
215
695814
3640
Et ce que les technologies de séquençage ADN permettent aux gens de faire maintenant
11:51
is do detailed studies of, say, 100 patients who have Crohn's disease
216
699454
6952
c'est de faire des études détaillées de, disons, 100 patients atteints de la maladie de Crohn
11:58
and 100 people who don't have Crohn's disease.
217
706406
2535
et de 100 personnes qui n'ont pas la maladie de Crohn.
12:00
Or 100 people who took antibiotics when they were little,
218
708941
3833
Ou 100 personnes qui ont pris des antibiotiques quand ils étaient petits,
12:04
and 100 people who did not take antibiotics.
219
712774
2424
et 100 personnes qui n'ont pas pris d'antibiotiques.
12:07
And we can now start to compare the community of microbes
220
715198
4080
Et nous pouvons maintenant commencer à comparer la communauté des microbes
12:11
and their genes and see if there are differences.
221
719278
3303
et leurs gènes et voir s'il y a des différences.
12:14
And eventually we may be able to understand if they're not
222
722581
3402
Et finalement nous pourrions être capables de comprendre si ce ne sont pas
12:17
just correlative differences, but causative.
223
725983
2624
de simples différences corrélatives, mais causatives.
12:20
Studies in model systems like mouse and other animals
224
728607
3470
Des études de systèmes modèles, comme les souris et d'autres animaux
12:24
are also helping do this, but people are now using
225
732077
3209
contribuent également à le faire, mais les gens utilisent maintenant
12:27
these technologies because they've gotten very cheap,
226
735286
2304
ces technologies car elles sont devenues très bon marché,
12:29
to study the microbes in and on a variety of people.
227
737590
3914
pour étudier les microbes dans et sur un large éventail de personnes.
12:33
So, in wrapping up, what I want to tell you about is,
228
741504
4590
Donc, pour récapituler ce dont je veux vous parler,
12:38
I didn't tell you a part of the story of coming down with diabetes.
229
746094
3207
je ne vous ai pas raconté une partie de l'histoire de devenir diabétique.
12:41
It turns out that my father was an M.D.,
230
749301
2764
Il s'avère que mon père était médecin,
12:44
actually studied hormones. I told him many times
231
752065
4472
en fait il étudiait les hormones. Je lui ai dit de nombreuses fois
12:48
that I was tired, thirsty, not feeling very good.
232
756537
4790
que j'étais fatigué, assoiffé, que je ne me sentais pas très bien.
12:53
And he shrugged it off, I think he either thought
233
761327
2879
Et il me laissait dire, je crois qu'il pensait que soit
12:56
I was just complaining a lot, or it was the typical
234
764206
3279
je me plaignais beaucoup, ou c'était la réaction typique
12:59
M.D. "nothing can be wrong with my children."
235
767485
2619
du médecin « rien ne peut aller mal avec mes enfants. »
13:02
We even went to the International Society of Endocrinology
236
770104
3221
Nous sommes même allés à une réunion de la Société Internationale d'Endocrinologie
13:05
meeting as family in Quebec.
237
773325
2130
en famille au Québec.
13:07
And I was getting up every five minutes to pee,
238
775455
5494
Et je me levais toutes les cinq minutes pour faire pipi,
13:12
and drinking everybody's water at the table,
239
780949
2435
et boire de l'eau de tout le monde à table,
13:15
and I think they all thought I was a druggie.
240
783384
2934
et je pense qu'ils ont tous pensé que j'étais un drogué.
13:18
(Laughter)
241
786318
1720
(Rires)
13:20
But the reason I'm telling you this is that
242
788038
1976
Mais si je vous dis ça, c'est que
13:22
the medical community, my father as an example,
243
790014
3000
la communauté médicale, mon père à titre d'exemple,
13:25
sometimes doesn't see what's right in front of their eyes.
244
793014
3567
parfois ne voit pas ce qui est juste devant ses yeux.
13:28
The microbial cloud, it is right in front of us.
245
796581
3985
Le nuage microbien, il est juste devant nous.
13:32
We can't see it most of the time. It's invisible.
246
800566
2800
Nous ne pouvons pas le voir la plupart du temps. Il est invisible.
13:35
They're microbes. They're tiny.
247
803366
1471
Ce sont des microbes. Ils sont minuscules.
13:36
But we can see them through their DNA,
248
804837
2952
Mais nous pouvons les voir à travers leur ADN,
13:39
we can see them through the effects that they have on people.
249
807789
3249
Nous pouvons les voir à travers les effets qu'ils ont sur les gens.
13:43
And what we need now
250
811038
1618
Et maintenant nous devons commencer
13:44
is to start thinking about this microbial community in the context
251
812656
3669
à réfléchir à cette communauté microbienne dans le contexte
13:48
of everything in human medicine.
252
816325
2513
de toute la médecine humaine.
13:50
It doesn't mean that it affects every part of us,
253
818838
3067
Cela ne signifie pas qu'elle affecte chaque partie de nous,
13:53
but it might.
254
821905
1399
mais elle le pourrait.
13:55
What we need is a full field guide to the microbes
255
823304
3925
Ce qu'il nous faut c'est un guide pratique complet sur les microbes
13:59
that live in and on people, so that we can understand
256
827229
3393
qui vivent dans et sur les gens, pour que nous puissions comprendre
14:02
what they're doing to our lives.
257
830622
3272
ce qu'ils font de nos vies.
14:05
We are them. They are us.
258
833894
3071
Nous sommes eux. Ils sont nous.
14:08
Thank you.
259
836965
1328
Merci.
14:10
(Applause)
260
838293
1985
(Applaudissements)
ABOUT THE SPEAKER
Jonathan Eisen - BiologistJonathan Eisen studies the ecology and evolution of microbial communities -- and their co-evolution with their hosts.
Why you should listen
Research in Jonathan Eisen's lab focuses on the “phylogenomics of novelty” in microbes. Among their major research themes are:
• the genomic basis for the origin and evolution of new functions
• the ecology and evolution of microbial communities
• the co-evolution of microbes and their carrying vessels (i.e., hosts)
• variation in “evolvability”
• the development of phylogeny driven computational tools to analyze genomic and metagenomic sequence data.
Eisen is also a strong proponent of the Open Access movement in scientific publishing and is Academic Editor in Chief of PLoS Biology. Dr. Eisen is also an active and award-winning science blogger on The Tree of Life. For recent news see @phylogenomics.
Jonathan Eisen | Speaker | TED.com