TED2012
Christina Warinner: Tracking ancient diseases using ... plaque
Christina Warinner : Sur la piste des maladies anciennes ... grâce à la plaque dentaire
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Imaginez ce que nous pourrions apprendre sur les maladies en étudiant l'histoire des maladies humaines, des anciens hominidés jusqu'à nos jours. Mais comment? Chritina Warinner, TED Fellow, es généticienne archéologue, et elle a trouvé un nouvel outil spectaculaire -- de l'ADN microbien dans de la plaque dentaire fossilisée.
Christina Warinner - Archaeological geneticist
Christina Warinner is a researcher at the University of Zurich, where she studies how humans have co-evolved with environments, diets and disease. Full bio
Christina Warinner is a researcher at the University of Zurich, where she studies how humans have co-evolved with environments, diets and disease. Full bio
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Have you ever wondered
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2000
Vous êtes-vous déjà demandé
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what is inside your dental plaque?
1
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ce qui est à l'intérieur de votre plaque dentaire ?
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Probably not, but people like me do.
2
5000
2000
Probablement pas, mais les gens comme moi, oui.
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I'm an archeological geneticist
3
7000
2000
Je suis généticien archéologue
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at the Center for Evolutionary Medicine
4
9000
2000
au Centre pour la médecine évolutive
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at the University of Zurich,
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11000
2000
à l'Université de Zurich,
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and I study the origins and evolution of human health and disease
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13000
3000
et j'étudie les origines et l'évolution de la santé humaine et des maladies
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by conducting genetic research
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16000
2000
en menant des recherches génétiques
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on the skeletal and mummified remains of ancient humans.
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3000
sur les restes squelettiques et momifiés des anciens hommes.
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And through this work, I hope to better understand
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21000
3000
Et grâce à ce travail, j'espère mieux comprendre
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the evolutionary vulnerabilities of our bodies,
10
24000
2000
les vulnérabilités évolutives de notre corps,
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so that we can improve
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3000
afin que nous puissions améliorer
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and better manage our health in the future.
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2000
et mieux gérer notre santé à l'avenir.
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There are different ways to approach evolutionary medicine,
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Il existe différentes façons d'aborder la médecine évolutionniste
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and one way is to extract human DNA
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34000
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et une de ces manières est d'extraire l'ADN humain
00:51
from ancient bones.
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36000
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d'os anciens.
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And from these extracts,
16
38000
2000
Et à partir de ces extraits,
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we can reconstruct the human genome at different points in time
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40000
3000
nous pouvons reconstituer le génome humain à différents points dans le temps
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and look for changes that might be related to adaptations,
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et rechercher les modifications qui pourraient être liées à des adaptations,
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risk factors and inherited diseases.
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46000
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des facteurs de risque et des maladies héréditaires.
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But this is only one half of the story.
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Mais ce n'est qu'une moitié de l'histoire.
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The most important health challenges today
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52000
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Les problèmes de santé les plus importants aujourd'hui
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are not caused by simple mutations in our genome,
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ne sont pas causés par de simples mutations dans notre génome,
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but rather result from a complex and dynamic interplay
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mais sont plutôt le résultat d'une interaction complexe et dynamique
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between genetic variation,
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61000
2000
entre la variation génétique,
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diet, microbes and parasites
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le régime alimentaire, les microbes et les parasites
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and our immune response.
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65000
2000
et notre réponse immunitaire.
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All of these diseases
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67000
2000
Toutes ces maladies
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have a strong evolutionary component
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69000
2000
ont une forte composante évolutive
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that directly relates to the fact
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71000
2000
qui est directement liée au fait
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that we live today in a very different environment
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73000
2000
que nous vivons aujourd'hui dans un environnement très différent
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than the ones in which our bodies evolved.
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75000
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que ceux dans lesquels notre corps a évolué.
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And in order to understand these diseases,
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78000
2000
Et afin de comprendre ces maladies,
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we need to move past studies of the human genome alone
33
80000
3000
on doit dépasser les études du seul génome humain
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and towards a more holistic approach
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83000
2000
pour aller vers une approche plus globale
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to human health in the past.
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85000
2000
de la santé humaine dans le passé.
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But there are a lot of challenges for this.
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87000
2000
Mais cela présente beaucoup de problèmes.
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And first of all, what do we even study?
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89000
3000
Et tout d'abord, qu'est-ce que nous étudions en fait ?
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Skeletons are ubiquitous; they're found all over the place.
38
92000
3000
Les squelettes sont omniprésents ; on les trouve partout.
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But of course, all of the soft tissue has decomposed,
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95000
3000
Mais bien sûr, tous les tissus mous se sont décomposés,
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and the skeleton itself
40
98000
2000
et le squelette lui-même
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has limited health information.
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100000
2000
a des renseignements sur la santé limités.
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Mummies are a great source of information,
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102000
2000
Les momies sont une excellente source d'information,
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except that they're really geographically limited
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104000
3000
sauf qu'elles sont vraiment limitées géographiquement
02:02
and limited in time as well.
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107000
2000
et aussi limitées dans le temps.
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Coprolites are fossilized human feces,
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109000
3000
Les coprolithes sont des selles humaines fossilisées ,
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and they're actually extremely interesting.
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112000
2000
et ils sont effectivement très intéressants.
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You can learn a lot about ancient diet and intestinal disease,
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114000
3000
Vous pouvez en apprendre beaucoup sur le régime ancien et les maladies intestinales
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but they are very rare.
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117000
2000
mais ils sont très rares.
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(Laughter)
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119000
3000
(Rires)
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So to address this problem,
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122000
2000
Pour résoudre ce problème,
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I put together a team of international researchers
51
124000
2000
j'ai mis sur pied une équipe de chercheurs internationaux
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in Switzerland, Denmark and the U.K.
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126000
2000
en Suisse, au Danemark et au Royaume-Uni.
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to study a very poorly studied, little known material
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128000
6000
pour étudier un matériau très mal étudié, peu connu
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that's found on people everywhere.
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134000
2000
que l'on retrouve sur les gens partout dans le monde.
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It's a type of fossilized dental plaque
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136000
3000
C'est un type de plaque dentaire fossilisée
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that is called officially dental calculus.
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139000
3000
qu'on appelle officiellement calcul dentaire.
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Many of you may know it by the term tartar.
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142000
2000
Beaucoup d'entre vous le connaissent peut-être sous le nom de tartre.
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It's what the dentist cleans off your teeth
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144000
2000
C'est ce que le dentiste enlève de vos dents
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every time that you go in for a visit.
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146000
2000
chaque fois que vous allez le voir pour un contrôle.
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And in a typical dentistry visit,
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148000
2000
Et lors d'un controle dentaire typique,
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you may have about 15 to 30 milligrams removed.
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150000
3000
on peut vous en enlever environ 15 à 30 milligrammes.
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But in ancient times before tooth brushing,
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3000
Mais dans les temps anciens, avant le brossage des dents,
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up to 600 milligrams might have built up on the teeth
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156000
3000
jusqu'à 600 milligrammes pouvaient s'accumuler sur les dents
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over a lifetime.
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2000
au cours d'une vie entière.
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And what's really important about dental calculus
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161000
3000
Et ce qui est vraiment important avec le calcul dentaire
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is that it fossilizes just like the rest of the skeleton,
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164000
3000
est qu'il se fossilise tout comme le reste du squelette,
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it's abundant in quantity before the present day
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167000
3000
il en trouve en grande quantité avant aujourd'hui
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and it's ubiquitous worldwide.
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170000
2000
et il est omniprésent dans le monde entier.
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We find it in every population around the world at all time periods
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172000
3000
Nous en trouvons chez chaque population du monde entier à toutes les époques
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going back tens of thousands of years.
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175000
2000
en remontant des dizaines de milliers d'années.
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And we even find it in neanderthals and animals.
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177000
3000
Et nous en trouvons même chez les animaux et les néandertaliens.
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And so previous studies
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180000
2000
Et les études précédentes
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had only focused on microscopy.
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182000
2000
n'avaient porté que sur la microscopie.
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They'd looked at dental calculus under a microscope,
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184000
2000
Ils avaient regardé le calcul dentaire sous le microscope,
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and what they had found was things like pollen
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186000
3000
et ils avaient trouvé des choses comme du pollen
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and plant starches,
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189000
2000
et des amidons de végétaux,
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and they'd found muscle cells from animal meats
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191000
2000
et ils avaient trouvé des cellules musculaires de viande animale
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and bacteria.
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193000
2000
et les bactéries.
03:30
And so what my team of researchers, what we wanted to do,
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195000
3000
Et donc ce que mon équipe de chercheurs, ce que nous voulions faire,
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is say, can we apply
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198000
2000
c'est, pouvons-nous appliquer
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genetic and proteomic technology
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200000
2000
la génétique et la technologie protéomique
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to go after DNA and proteins,
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202000
2000
pour chercher de l'ADN et des protéines,
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and from this can we get better taxonomic resolution
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204000
3000
et de là pouvons-nous obtenir une meilleure résolution taxonomique
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to really understand what's going on?
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207000
2000
pour vraiment comprendre ce qui se passe ?
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And what we found
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209000
2000
Et ce que nous avons trouvé
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is that we can find many commensal and pathogenic bacteria
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211000
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est que nous pouvons trouver beaucoup de bactéries commensales et pathogènes
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that inhabited the nasal passages and mouth.
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213000
3000
qui logeaient dans les voies nasales et la bouche.
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We also have found immune proteins
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216000
3000
Nous avons également trouvé des protéines immunitaires
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related to infection and inflammation
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219000
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liées à l'infection et l'inflammation
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and proteins and DNA related to diet.
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222000
3000
et de l'ADN et des protéines liés au régime alimentaire.
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But what was surprising to us, and also quite exciting,
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3000
Mais ce qui nous a surpris et qui était aussi tout à fait passionnant,
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is we also found bacteria
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228000
2000
est que nous avons également trouvé des bactéries
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that normally inhabit upper respiratory systems.
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230000
2000
qui logent normalement dans les systèmes respiratoires supérieurs.
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So it gives us virtual access to the lungs,
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232000
3000
Donc cela nous donne un accès virtuel aux poumons,
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which is where many important diseases reside.
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235000
3000
où résident de nombreuses maladies importantes.
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And we also found bacteria
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238000
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Et nous avons également trouvé des bactéries
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that normally inhabit the gut.
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240000
2000
qui logent normalement dans le tube digestif.
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And so we can also now virtually gain access
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242000
3000
Et donc nous pouvons maintenant accéder virtuellement
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to this even more distant organ system
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245000
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à ce système d'organes encore plus éloigné
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that, from the skeleton alone,
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qui, à partir du squelette seul,
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has long decomposed.
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249000
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s'est décomposé depuis longtemps.
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And so by applying ancient DNA sequencing
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Et donc en appliquant le séquençage de l'ADN ancien
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and protein mass spectrometry technologies
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253000
2000
et les technologies de spectrométrie de masse des protéines
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to ancient dental calculus,
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255000
2000
à l'ancien calcul dentaire,
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we can generate immense quantities of data
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257000
3000
nous pouvons générer d'immenses quantités de données
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that then we can use to begin to reconstruct a detailed picture
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260000
3000
qu'alors nous pouvons utiliser pour commencer à reconstruire une image détaillée
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of the dynamic interplay
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263000
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de l'interaction dynamique
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between diet, infection and immunity
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265000
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entre l'alimentation, l'infection et l'immunité
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thousands of years ago.
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il y a des milliers d'années.
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So what started out as an idea,
110
269000
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Donc ce qui a commencé comme une idée,
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is now being implemented
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271000
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est maintenant mis en œuvre
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to churn out millions of sequences
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pour produire des millions de séquences
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that we can use to investigate
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275000
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que nous pouvons utiliser pour enquêter sur
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the long-term evolutionary history of human health and disease,
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277000
3000
l'évolution à long terme de la santé humaine et des maladies,
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right down to the genetic code of individual pathogens.
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jusqu'au code génétique des agents pathogènes individuels.
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And from this information
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Et de ces informations
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we can learn about how pathogens evolve
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285000
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nous pouvons apprendre comment les agents pathogènes évoluent
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and also why they continue to make us sick.
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287000
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et aussi pourquoi ils continuent de nous rendre malades.
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And I hope I have convinced you
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Et j'espère que je vous ai convaincus
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of the value of dental calculus.
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292000
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de la valeur du calcul dentaire.
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And as a final parting thought,
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Et la dernière pensée sur laquelle je veux vous laisser,,
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on behalf of future archeologists,
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au nom des futurs archéologues,
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I would like to ask you to please think twice
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je voudrais vous demander de réfléchir à deux fois
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before you go home and brush your teeth.
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302000
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avant de rentrer chez vous et de vous brossez les dents.
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(Applause)
125
304000
2000
(Applaudissements)
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Thank you.
126
306000
2000
Merci.
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(Applause)
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308000
2000
(Applaudissements)
ABOUT THE SPEAKER
Christina Warinner - Archaeological geneticistChristina Warinner is a researcher at the University of Zurich, where she studies how humans have co-evolved with environments, diets and disease.
Why you should listen
Tna analyzes DNA from the bones and teeth of ancient people to study human evolution in response to changes in infectious disease, diet and the environment over the last 10,000 years. Using samples from ancient skeletons and mummies, she investigates how and why lactase persistence, alcohol intolerance and HIv-resistance have evolved in different populations around the world. As an archaeogeneticist, she’s particularly interested in bridging the gap between archaeology, anthropology and the biomedical sciences.
Christina Warinner | Speaker | TED.com